当公司主动确认劳动关系时，需要明确以下几点关键内容，以确保劳动关系的合法性和明确性：

一、主体资格的符合性

首先，要确认用人单位和劳动者双方是否都符合法律、法规规定的主体资格。这是确立劳动关系的基础，确保双方都是合法的用工和就业主体。

二、劳动规章制度的适用性

其次，需要明确用人单位依法制定的各项劳动规章制度是否适用于劳动者。这包括但不限于工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利等规定。劳动者应当受到这些规章制度的约束，并接受用人单位的劳动管理。

三、劳动报酬与劳动管理的关系

劳动者必须从事用人单位安排的有报酬的劳动。这意味着劳动者提供的劳动是有偿的，并且其劳动过程受到用人单位的监督和管理。这是劳动关系与劳务关系等其他关系的重要区别之一。

四、劳动业务组成部分的确认

劳动者提供的劳动必须是用人单位业务的组成部分。这要求劳动者的劳动内容与用人单位的经营范围、业务需求等紧密相关，是用人单位正常运营不可或缺的一部分。

五、相关凭证的留存与举证

在确认劳动关系时，双方应留存并准备好相关凭证，如工资支付凭证、社会保险费缴纳记录、工作证、服务证、招工招聘登记表、报名表、考勤记录等。这些凭证在发生劳动争议时，可以作为证明劳动关系存在的重要依据。特别是工资支付凭证、招工招聘记录、考勤记录等，根据相关规定，应由用人单位负举证责任。

六、劳动合同的补签与终止

如果用人单位在招用劳动者时未签订书面劳动合同，但符合上述劳动关系成立的情形，用人单位应当与劳动者补签劳动合同。劳动合同期限由双方协商确定，协商不一致的，任何一方均可提出终止劳动关系。但需注意，对于符合签订无固定期限劳动合同条件的劳动者，如果劳动者提出订立无固定期限劳动合同，用人单位应当订立。

七、特殊用工主体的责任

对于建筑施工、矿山企业等特殊行业，如果用人单位将工程（业务）或经营权发包给不具备用工主体资格的组织或自然人，那么对该组织或自然人招用的劳动者，由具备用工主体资格的发包方承担用工主体责任。

八、争议解决途径

如果劳动者与用人单位就是否存在劳动关系引发争议，可以向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。这是解决劳动关系争议的重要法律途径。

综上所述，公司在主动确认劳动关系时，需要综合考虑以上各方面因素，确保劳动关系的合法性和明确性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，建议咨询专业的法律人士或劳动争议仲裁机构。