结论：危险驾驶罪员工主动辞职，是否扣奖金需视具体情况而定，包括公司规章制度、劳动合同约定以及员工行为对公司的影响等因素。
分析：
公司规章制度与劳动合同约定：
- 首先，需要查阅公司的规章制度以及员工与公司签订的劳动合同，看其中是否有关于员工因犯罪行为（包括危险驾驶罪）主动辞职时，公司是否有权扣除奖金的明确规定。
- 如果规章制度或劳动合同中有明确规定，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司有权按照约定扣除奖金。
员工行为对公司的影响：
- 危险驾驶罪是一种严重的违法行为，不仅可能危及公共安全，还可能对公司形象造成负面影响。
- 如果员工的行为已经对公司造成了实际损失或不良影响，公司可能会根据内部规定或劳动合同中的相关条款，对员工进行相应的处罚，包括扣除奖金。
法律法规的考量：
- 在扣除奖金时，公司必须确保其行为不违反法律法规的强制性规定。例如，不能违反《劳动法》、《劳动合同法》中关于工资支付、劳动报酬保护等的相关规定。
- 如果公司扣除奖金的行为缺乏合法依据或违反了法律法规，员工有权向劳动争议仲裁委员会或人民法院提起申诉或诉讼，要求公司支付被扣除的奖金。
建议：
- 对于员工而言，在主动辞职前，应仔细阅读公司的规章制度和劳动合同，了解其中关于奖金支付和扣除的相关规定。
- 如果员工认为公司扣除奖金的行为缺乏合法依据或违反了法律法规，可以与公司进行协商，要求公司支付被扣除的奖金。如果协商无果，可以向劳动争议仲裁委员会或人民法院提起申诉或诉讼。
- 对于公司而言，在制定规章制度和劳动合同时，应明确关于奖金支付和扣除的相关规定，并确保这些规定不违反法律法规的强制性规定。同时，在扣除员工奖金时，应确保有合法依据和合理理由，并遵循相关程序。
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