在行政立案的现阶段进行协商退款，您确实可以主张损失，但具体能否得到支持以及支持的范围，需结合实际情况和法律规定来综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律背景与原则
损失主张的法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，当事人在合同履行过程中因对方违约或违法行为遭受损失的，有权要求对方进行赔偿。这一原则同样适用于行政立案后的协商退款场景。
行政立案与民事赔偿的关系：
- 行政立案主要关注的是行政违法行为的查处，而民事赔偿则关注的是因违法行为给当事人造成的经济损失的填补。两者并不冲突，您可以在行政立案的同时或之后，通过协商或诉讼等方式主张民事赔偿。
二、主张损失的具体情况
协商退款中的损失主张：
- 在协商退款过程中，您可以明确提出因对方违约或违法行为给您造成的具体损失，如直接经济损失（如已支付的款项、因违约导致的额外费用等）和间接经济损失（如因违约导致的业务中断、信誉损失等）。
- 协商时，您可以提供相关证据来支持您的损失主张，如合同、付款凭证、损失计算依据等。
行政立案对损失主张的影响：
- 行政立案本身并不直接决定您能否主张损失或损失的大小，但它可能为您主张损失提供一定的证据支持或背景信息。
- 如果行政立案后，行政机关对违法行为进行了查处并作出了行政处罚决定，该决定可能作为您主张损失的重要依据。
三、可能面临的挑战与建议
损失证明的难度：
- 在主张损失时，您可能需要面临损失证明的难度。特别是间接经济损失，如信誉损失、业务中断损失等，往往难以直接量化。
- 建议：您应尽可能收集相关证据来支持您的损失主张，如客户流失记录、业务中断期间的财务报表、专家评估意见等。
协商与诉讼的选择：
- 在行政立案后，您可以选择通过协商方式解决退款和损失赔偿问题，也可以选择通过诉讼方式解决。
- 建议：如果双方能够就退款和损失赔偿达成一致意见，协商方式可能更为高效和经济。如果协商无果，您可以考虑通过诉讼方式维护自己的合法权益。
四、实际操作中的注意事项
及时主张损失：
- 您应在发现损失后及时主张，避免因时间拖延而导致证据灭失或损失扩大。
保留相关证据：
- 您应妥善保留与损失相关的所有证据，包括合同、付款凭证、损失计算依据、沟通记录等。
寻求专业帮助：
- 如果您在主张损失过程中遇到困难或疑问，可以寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供法律咨询、证据收集、协商谈判等全方位的法律服务。
综上所述，在行政立案的现阶段进行协商退款时，您确实可以主张损失。但具体能否得到支持以及支持的范围，需结合实际情况和法律规定来综合判断。如果您在主张损失过程中遇到任何问题或疑问，可以直接向我咨询。