税款在民事交易中是可以约定由对方承担的，但这种约定不影响法定纳税义务的履行。以下是对此问题的详细分析：
一、约定的合法性
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体从事民事活动应遵循自愿原则，按照自己的意思设立、变更、终止民事法律关系。合同作为民事法律行为的一种重要形式，其内容由当事人自主协商确定，只要不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，即具有法律效力。因此，当事人在合同中约定税费的承担方式是合法有效的，受法律保护。
二、纳税义务人的法定性
税法规定了各个税种的纳税义务人是法定的，如增值税的纳税义务人是销售货物或提供应税劳务、服务的单位和个人。这意味着，即使合同中约定了由一方承担税费，法定的纳税义务人仍需按照税法规定履行纳税申报和缴纳税款的义务。例如，在商品销售中，销售方是增值税的纳税义务人，无论合同如何约定，销售方都需承担增值税的缴纳责任。
三、税费承担与纳税义务的区别
纳税义务是向税务机关承担的法定责任，包括支付税费、办理纳税登记、纳税申报等。而税费承担则是合同各方之间的约定，仅对合同当事人具有约束力，不影响纳税义务的履行。例如，在二手房交易中，买卖双方可能约定契税由买方承担，但这并不改变卖方作为法定纳税义务人的地位，卖方仍需按照税法规定办理相关纳税手续。
四、实际操作中的建议与风险
明确约定：在商业交易中，双方可以约定税费的承担方式，但应明确这种约定不影响纳税义务的履行。建议在合同中明确注明该条款的性质和效力，例如：“本次交易产生的增值税由买方承担，但卖方作为法定纳税义务人，仍需按照税法规定履行纳税申报和缴纳税款的义务。”
考虑实际履行能力：在约定税费承担时，应考虑双方的实际履行能力和风险承受能力。如果一方无法承担约定的税费，可能导致合同无法顺利履行。例如，在股权转让中，如果转让方无法承担所得税，可能导致股权转让无法完成。
注意税费变化：税收政策可能随时间发生变化，当事人在签订合同时应关注相关政策动态，并在合同中约定相应的调整机制或处理方式。例如，可以约定：“如因税收政策变化导致税费增加或减少，双方应按照新的税收政策协商调整税费承担方式。”
风险防范：若约定由对方承担税费，应确保该条款不存在无效情形（如欺诈、胁迫、恶意串通等），否则可能面临追偿困难。例如，在签订合同时，应确保双方是在平等、自愿的基础上进行协商，且合同条款不违反法律法规的强制性规定。
五、特殊情况下的税款承担
在特殊场景（如劳务报酬所得）下，根据《中华人民共和国个人所得税法》，劳务发票的个税由提供劳务的个人承担。但这不适用于一般的商品销售或服务提供场景。因此，在约定税费承担时，应充分考虑交易的具体性质和税法规定。
总结来说，虽然税款的实际承担者可以通过合同约定来确定，但这并不改变法定纳税义务人的纳税责任。双方在约定税费承担时，应充分考虑法律法规的限制和风险，并确保合同条款的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。