结论：公司删除考勤记录并以此为由辞退员工，这一行为是否合法需视具体情况而定，但员工有权采取一系列措施来维护自己的合法权益。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、公司行为的合法性分析
考勤记录的重要性：
- 考勤记录是员工出勤情况的直接证据，对于确定员工是否存在迟到、早退、旷工等行为至关重要。
- 公司若要辞退员工，通常需要提供充分的证据证明员工存在严重违反公司规章制度或法律法规的行为。
删除考勤记录的合法性：
- 公司单方面删除考勤记录，可能构成对证据的销毁或篡改，这一行为本身可能违法，尤其是在涉及劳动纠纷时。
- 如果公司无法提供其他有效证据证明员工存在违纪行为，仅凭删除的考勤记录作为辞退依据，可能面临法律风险。
辞退的合法性：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，公司辞退员工必须符合法定条件，如员工严重违反公司规章制度、严重失职给公司造成重大损害等。
- 若公司无法证明员工存在上述违纪行为，其辞退决定可能被认定为违法解除劳动合同。
二、员工应采取的措施
收集证据：
- 员工应尽快收集与考勤相关的证据，如工作记录、同事证言、电子邮件、短信等，以证明自己的出勤情况。
- 如果可能，员工还可以尝试恢复被删除的考勤记录，或要求公司提供其他形式的出勤证明。
与公司协商：
- 在收集到一定证据后，员工可以尝试与公司进行协商，要求公司撤销辞退决定或提供合理的补偿。
- 协商过程中，员工应保持冷静和理性，避免情绪化行为影响协商结果。
申请劳动仲裁：
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司承担违法解除劳动合同的法律责任。
- 在申请劳动仲裁时，员工需要提交相关证据和仲裁申请书，并按照仲裁机构的程序进行仲裁。
寻求法律援助：
- 如果员工对劳动仲裁结果不满意或认为仲裁过程存在不公，还可以向法院提起诉讼。
- 在此过程中，员工可以寻求专业律师的法律援助，以确保自己的合法权益得到充分维护。
三、可能的法律后果
公司承担违法解除劳动合同的责任：
- 如果公司被认定为违法解除劳动合同，可能需要向员工支付赔偿金、继续履行劳动合同或恢复劳动关系等。
员工获得相应补偿：
- 无论仲裁还是诉讼结果如何，员工都有权根据实际情况获得相应的经济补偿或赔偿。
建议：面对公司删除考勤记录并以此为由辞退的情况，员工应保持冷静，积极收集证据，与公司协商或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。如有需要，可直接向我咨询相关法律问题，我将为你提供专业的法律意见和帮助。