法定节假日工资不会扣除加班费，且法定节假日加班的，用人单位需额外支付加班费。以下是对这一问题的详细分析：

一、法定节假日工资支付规定

根据《中华人民共和国劳动法》第五十一条的规定，劳动者在法定休假日期间，即使未提供劳动，用人单位也应当依法支付其正常的工资。这意味着法定节假日属于带薪休假，用人单位不得因劳动者休息而扣减工资。因此，法定节假日的工资是正常发放的，不会扣除任何费用，包括加班费。

二、法定节假日加班工资的计算与支付

若用人单位安排劳动者在法定节假日工作，根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，应支付不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%作为加班工资。具体计算公式为：

• 月工资基数 ÷ 21.75天 × 300% × 加班天数

这里，21.75天是通常的月计薪天数。例如，若劳动者的月工资为5000元，在法定节假日加班一天，则其应得加班费为：

• 5000元 ÷ 21.75天 × 300% × 1天 ≈ 689.66元

此加班费为额外支付，不包含当日正常工资。也就是说，劳动者在法定节假日加班的，除了获得正常的工资外，还能获得额外的加班费。

三、实际案例说明

以员工小张为例，假设其月工资为5000元，当月包含元旦、春节等法定节假日，且小张按规定休假。那么，用人单位应全额支付这5000元工资，不得扣除法定节假日对应的工资部分。若小张在这些节假日被安排加班，则应按上述公式计算并支付加班费。

四、劳动者的权益保护

如果用人单位违反规定，扣发劳动者法定节假日的工资或未按规定支付加班费，劳动者首先可以尝试与用人单位协商解决。协商不成的，劳动者有权向当地的劳动行政部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。劳动行政部门将依法对用人单位进行监督检查，并责令其改正违法行为。

五、特别提醒

• 法定节假日加班不适用补休替代加班费支付，因为法定节假日具有特殊的法律意义，劳动者的休息权受到特别保护。
• 如果劳动合同中对加班工资基数有约定，应按照约定计算，但该约定不得低于当地最低工资标准。

综上所述，法定节假日工资不会扣除加班费，且法定节假日加班的，用人单位需额外支付加班费。劳动者应了解自己的权利，并在必要时采取适当的措施来维护这些权利。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。