结论：员工在职申请劳动仲裁时，公司不让上班的情况需根据具体情形来判断员工是否应继续上班，并需采取相应措施保护自身权益。

详细分析：

1. 劳动合同存续且正常履行

   • 如果员工与公司的劳动合同仍然有效，且没有出现如停工停产、公司明确通知不用上班等特殊情形，员工有义务按照劳动合同的约定继续到岗上班，遵守公司的规章制度。这是因为劳动仲裁期间，劳动关系依旧存续，员工应履行劳动义务以获取报酬。若员工无故不上班，可能构成旷工，公司有权依据规章制度进行处理。

2. 公司要求停止工作

   • 若公司以书面通知等明确方式要求员工停止工作，等待劳动仲裁结果，员工可以据此不再到岗，但应妥善保留好相关通知证据。这种情况下，视为公司对员工工作安排的一种决定，员工无需承担旷工的责任。

3. 存在争议的情况

   • 当双方对于是否需要继续上班存在争议，如公司没有明确说法但以实际行动阻止员工正常工作，或者员工因担心遭受不公平对待而不敢去上班时，员工应通过书面形式向公司询问上班要求和安排，并保留沟通记录。同时，可以向劳动监察部门反映情况，以确定自身义务并寻求帮助。

4. 因公司或自身原因不能上班

   • 如因公司原因导致员工无法正常上班（如停职、停薪、工作环境存在安全隐患等），员工可以不到公司上班，并需保留好相关证据，如停职通知、停薪证明、工作环境照片或视频等。
   • 若员工因身体或精神状况不适宜继续工作，且有医疗证明等材料支持，可以向公司请假暂时不上班，并保留好医疗证明和请假记录。

5. 劳动仲裁期间的注意事项

   • 仲裁时效：员工应确保仲裁时效未过，劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。
   • 证据准备：员工需要准备充分的证据材料，如劳动合同、工资条、考勤记录、公司通知、沟通记录、医疗证明等，以支持自己的仲裁请求。
   • 积极参与庭审：在劳动仲裁过程中，员工应积极参与陈述、举证、质证和辩论等环节，以维护自己的合法权益。

法律建议：

• 员工在遇到公司不让上班的情况时，应首先保持冷静，明确自己的权利和义务。
• 根据具体情况判断是否应继续上班，并妥善保留相关证据。
• 如与公司无法协商解决，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
• 在整个过程中，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师（即我，邓刚律师），以获取更具体的法律建议和帮助。

可能法律后果：

• 若员工无故旷工，可能面临公司的纪律处分，甚至被解除劳动合同。
• 若公司违法解除劳动合同或未支付劳动报酬等，员工有权要求公司支付赔偿金或经济补偿。
• 在劳动仲裁过程中，若员工胜诉，公司需履行仲裁裁决，如支付拖欠的工资、补缴社会保险等。