结论前置：在同时约定定金和违约金的情况下，企业法人作为合同一方，与项目经理部（通常作为企业法人的内部机构或代表）在法律关系上需明确责任主体，处理定金和违约金时，一般遵循“选择适用”原则，即企业法人或项目经理部（视合同主体而定）可选择适用定金罚则或违约金条款，但不得同时主张两者，除非合同有特别约定且该约定不违反法律强制性规定。

详细分析：

1. 法律关系明确：

   • 首先，需明确企业法人与项目经理部之间的法律关系。项目经理部通常是企业法人为完成特定项目而设立的临时机构，其民事责任一般由企业法人承担。因此，在合同中，若项目经理部作为签约主体，其法律效果往往直接归属于企业法人。

2. 定金与违约金的性质：

   • 定金：是合同当事人一方为了证明合同的成立和保证合同的履行，预先向对方支付的一定数量的金钱。定金具有担保性质，若给付定金的一方不履行约定的债务，无权要求返还定金；收受定金的一方不履行约定的债务，应当双倍返还定金。
   • 违约金：是合同当事人在合同中预先约定的，当一方不履行合同或不完全履行合同时，由违约方支付给对方的一定数额的金钱。违约金具有补偿性和惩罚性双重性质。

3. 同时约定定金和违约金的处理原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人既约定违约金，又约定定金的，一方违约时，对方可以选择适用违约金或者定金条款。这意味着，在同时约定定金和违约金的情况下，守约方不能同时主张两者，而只能选择其中之一进行主张。
   • 这一原则旨在防止守约方获得超额赔偿，维护合同的公平性和合理性。若合同中有特别约定，如“定金不足以弥补损失时，可另行主张违约金”，且该约定不违反法律强制性规定，则可能允许同时主张定金和部分违约金，但这种情况较为特殊，需具体分析合同条款和法律规定。

4. 实践建议：

   • 对于企业法人而言，在签订合同时，应明确约定定金和违约金的条款，并考虑两者之间的协调性和互补性。避免同时约定过高的定金和违约金，以免在违约时面临不必要的法律纠纷和经济损失。
   • 在发生违约时，企业法人或项目经理部（视合同主体而定）应根据实际情况和合同约定，合理选择适用定金罚则或违约金条款，以维护自身合法权益。

总结：在同时约定定金和违约金的情况下，企业法人或项目经理部（视合同主体而定）应遵循“选择适用”原则，根据合同约定和实际情况合理选择适用定金罚则或违约金条款。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。