在施工合同谈判时，若双方对项目经理变更的违约金不能达成一致，可以采取以下几种处理方式：

1. 继续协商，寻求共识：

   • 双方可以进一步深入沟通，了解彼此对项目经理变更违约金的担忧和期望，尝试找到一个双方都能接受的平衡点。
   • 协商过程中，可以参考行业惯例、类似案例的违约金标准，或者考虑项目经理变更对项目进度、质量、成本等方面的实际影响，来合理设定违约金数额。

2. 引入第三方调解或评估：

   • 如果双方协商陷入僵局，可以考虑引入第三方调解机构或专业评估机构，对项目经理变更的违约金进行客观、公正的评估或调解。
   • 第三方机构可以基于其专业知识和经验，提出一个相对合理的违约金标准，供双方参考和接受。

3. 在合同中设置灵活条款：

   • 如果双方对违约金数额确实难以达成一致，可以在合同中设置一些灵活条款，如违约金数额的调整机制、违约金与实际损失挂钩的条款等。
   • 这样，在项目经理发生变更时，可以根据实际情况对违约金数额进行调整，以更合理地反映双方的实际损失和利益。

4. 考虑法律后果与风险：

   • 双方应明确，如果合同中未约定违约金或违约金约定不明确，一旦发生项目经理变更等违约行为，可能需要根据实际损失进行赔偿，这可能涉及复杂的法律程序和证据收集。
   • 因此，在合同谈判时，双方应充分考虑法律后果和风险，尽量在合同中明确违约金的数额或计算方式，以减少后续纠纷和不确定性。

法律背景与建议：

• 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。因此，在施工合同中约定项目经理变更的违约金是合法的。
• 在约定违约金时，双方应遵循公平、合理、诚实信用的原则，确保违约金的数额与违约行为可能造成的损失相适应。如果违约金过高或过低，都可能引发法律纠纷。
• 如果双方确实无法就违约金数额达成一致，建议考虑在合同中明确违约金的调整机制或损失赔偿的计算方法，以便在发生违约行为时能够有据可依、减少纠纷。

可能的风险与后果：

• 如果合同中未约定违约金或违约金约定不明确，一旦发生项目经理变更等违约行为，双方可能因赔偿数额产生争议，进而引发法律诉讼或仲裁。
• 法律诉讼或仲裁程序可能耗时较长、成本较高，对双方的项目进度和合作关系都可能产生不利影响。

因此，在施工合同谈判时，双方应尽量就项目经理变更的违约金数额达成一致，并在合同中明确约定。如果确实无法达成一致，可以考虑采取上述处理方式，以降低后续纠纷的风险。如有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。