施工单位更换项目经理时，违约金处罚是可以协商减轻的。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同自由原则与协商空间
在建设工程合同中，关于项目经理的更换及违约金条款，通常是双方协商一致后订立的。根据合同自由原则，双方有权在合同履行过程中，就违约金等条款进行进一步的协商和调整。因此，如果施工单位因特殊原因需要更换项目经理，并且认为原定的违约金过高或存在其他不合理之处，可以与建设单位进行友好协商，寻求减轻违约金的可能性。
二、协商减轻违约金的考量因素
违约原因与情节：
- 如果施工单位更换项目经理是由于不可抗力因素（如项目经理突发重病、离职等）或建设单位同意的原因导致的，那么在协商减轻违约金时，这些因素可以作为有力的理由。
- 如果施工单位未经建设单位同意擅自更换项目经理，且没有合理的解释或理由，那么建设单位可能更倾向于坚持原定的违约金条款。
项目实际影响：
- 协商时，双方可以评估更换项目经理对项目进度、质量等实际影响。如果影响较小，建设单位可能更愿意考虑减轻违约金。
- 如果更换项目经理对项目造成了较大的负面影响，如导致项目延期、质量下降等，那么建设单位可能要求施工单位承担更高的违约责任。
双方合作关系与未来合作：
- 如果双方长期合作且关系良好，建设单位可能更愿意通过协商来解决问题，以维护双方的合作关系。
- 如果双方合作关系紧张或存在其他纠纷，建设单位可能更倾向于坚持原定的违约金条款，以作为对施工单位的制约。
三、协商减轻违约金的法律程序与建议
及时沟通：
- 施工单位在发现需要更换项目经理时，应及时与建设单位进行沟通，说明原因和情况，并提出协商减轻违约金的请求。
提供证据与理由：
- 施工单位应提供充分的证据和理由来支持其协商减轻违约金的请求，如项目经理的离职证明、不可抗力因素的证明等。
寻求第三方调解：
- 如果双方协商无果，可以寻求第三方调解机构的帮助，如人民调解委员会或行业调解组织，以促成双方达成和解。
注意合同条款与法律规定：
- 在协商过程中，双方应注意合同条款的约定以及相关法律法规的规定，确保协商结果合法有效。例如，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以协商一致变更合同内容。
四、协商不成的法律救济途径
如果双方无法就违约金减轻达成一致意见，施工单位仍需按照合同约定承担违约责任。此时，施工单位可以考虑以下法律救济途径：
仲裁：
- 如果合同中约定了仲裁条款，施工单位可以向约定的仲裁机构申请仲裁，由仲裁机构对纠纷进行裁决。
诉讼：
- 如果合同中没有约定仲裁条款或仲裁条款无效，施工单位可以向人民法院提起诉讼，由法院依法审理并作出判决。
建议：在实际操作中，施工单位应尽可能与建设单位进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决纠纷。同时，施工单位在签订合同时应仔细审查合同条款，确保合同内容明确、合理，以降低未来违约的风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。