不合法，公司不能以未缴纳社保为借口不支付劳动者工资，这是两个独立的法律义务。下面我从不同角度为你详细分析：

1. 工资支付义务：根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这是公司的法定义务，与是否缴纳社保无关。只要劳动者提供了正常劳动，公司就必须支付相应的工资。

2. 社保缴纳义务：同样，根据相关法律法规，用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。这也是公司的法定义务，但这一义务与工资支付义务是独立的。公司不能因为劳动者未同意或未配合缴纳社保（如果劳动者确实存在此类情况，公司应通过合法途径解决，如协商、投诉或法律诉讼，而非直接扣发工资），就拒绝支付工资。

3. 违法后果：如果公司以未缴纳社保为借口不支付工资，劳动者有权向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司支付拖欠的工资，并可能要求公司支付因拖欠工资而产生的经济补偿或赔偿金。同时，公司还可能因未依法缴纳社保而面临社保部门的处罚。

建议：如果你遇到了这种情况，首先可以尝试与公司协商解决，要求公司支付拖欠的工资并补缴社保。如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。