结论前置：节假日加班费是不扣除工资的，劳动者在法定节假日加班时，用人单位需在正常支付工资的基础上，额外支付相应的加班工资。

法律依据与分析：

根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，对于节假日加班工资的计算与支付，有着明确的标准。具体来说，法定节假日安排劳动者工作的，用人单位需支付不低于劳动者正常工作时间工资的百分之三百的工资报酬。这一规定清晰地表明，节假日加班费是在正常工资之外的额外支付，不应与日常工资相互抵扣。

工资与加班费的性质区分：

• 工资：是劳动者在正常工作时间内提供劳动应得的报酬，是劳动者基本生活费用的来源。
• 加班费：则是劳动者在超出正常工作时间、法定休息时间提供额外劳动所获得的补偿，旨在鼓励劳动者在特殊时期提供劳动，并保障其经济利益。

二者性质不同，不能相互抵扣。节假日加班费是对劳动者在特殊时期（如法定节假日）提供额外劳动的补偿，它独立于劳动者当日的正常工资之外。

举例说明：

以劳动者小李为例，假设其月工资（底薪）为6000元，每月计薪天数按21.75天计算，则小李的日工资约为275.86元。若小李在国庆节（法定节假日）加班一天，根据法律规定：

• 用人单位应首先正常支付小李当天的工资275.86元，这是小李正常出勤应得的报酬。
• 同时，用人单位还需额外支付小李300%的加班费，计算方式为\(275.86元 \times 3 = 827.58元\)。

因此，小李在国庆节加班这一天总共应获得的收入是：正常工资275.86元 + 加班费827.58元 = 1103.44元。

维权途径：

如果用人单位在支付节假日加班工资时存在扣除底薪的行为，这明显违反了法律规定。劳动者可以通过以下途径维护自身权益：

1. 与用人单位协商：首先尝试与用人单位进行沟通，了解其计算方式并表达自己的合法权益，要求用人单位按照法律规定支付加班费。
2. 向劳动监察部门投诉：如协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并纠正违法行为。
3. 申请劳动仲裁：若投诉仍未解决问题，劳动者可进一步申请劳动仲裁，通过法律程序来维护自己的权益。

特殊情况说明：

虽然一般情况下节假日加班费不应扣除工资，但也存在一些特殊情况。例如，如果劳动者与用人单位在劳动合同或集体合同中另有约定，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么可能按照约定执行。但这种情况较为少见，且约定内容必须合法合规。

综上所述，节假日加班费是不扣除工资的，且用人单位需按照法律规定额外支付加班费。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取合法途径维护自身利益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。