结论：小厂员工离职时能否结清工资，取决于多种因素，包括离职原因、劳动合同约定以及小厂是否存在违法行为等。以下从不同角度进行分析：
正常离职情况：
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动者在正常离职时，用人单位应当结清工资。这是劳动者的基本权益，也是用人单位的法定义务。
- 实际操作：如果员工是自愿离职，且没有与用人单位发生劳动争议，那么小厂应当在员工离职时结清工资。这通常包括基本工资、奖金、津贴等所有应得收入。
存在劳动争议情况：
- 争议内容：如果员工与小厂之间存在劳动争议，如工资计算错误、加班费未支付等，那么工资的结清可能会受到影响。
- 解决方式：在这种情况下，员工可以先与小厂进行协商，尝试解决争议。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
小厂存在违法行为情况：
- 违法行为类型：如果小厂存在未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等违法行为，员工有权依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十八条解除劳动合同，并要求小厂支付经济补偿。
- 经济补偿与工资结清：在这种情况下，员工不仅有权要求结清工资，还有权要求小厂支付经济补偿。经济补偿的计算方式依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条的规定进行。
法律建议：
- 保留证据：无论哪种情况，员工都应保留好与工资相关的证据，如工资条、银行转账记录等，以便在需要时证明自己的权益。
- 及时沟通：如果员工对工资结清有疑问或担忧，应及时与小厂进行沟通，了解具体情况并寻求解决方案。
- 寻求法律援助：如果员工与小厂之间的争议无法通过协商解决，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，以了解自己的法律权益和可行的维权途径。
可能后果：
- 如果小厂拒绝结清工资或存在违法行为，员工有权向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。一旦劳动监察部门或劳动仲裁机构认定小厂存在违法行为，小厂将面临法律责任，包括支付拖欠的工资、经济补偿以及可能的罚款等。
总之，小厂员工离职时能否结清工资取决于多种因素。如果员工对工资结清有疑问或担忧，建议及时与小厂沟通并寻求法律援助。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。