结论前置：关于“给了加班费，每天工作12小时是否违法”的问题，这需根据具体的工时制度及是否经过劳动行政部门的审批来判断。在标准工时制下，每天工作12小时一般违法；但在综合计算工时工作制或不定时工作制且经过审批的情况下，可能不违法。不过，无论哪种工时制度，加班费的支付都是必须的，且需符合法律规定。

一、工时制度的法律规定与判断

1. 标准工时制：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。同时，第三十八条规定用人单位应保证劳动者每周至少休息1日。
   • 判断：在标准工时制下，如果用人单位安排劳动者每天工作12小时，且没有合理的休息安排、调休、补休措施，这种做法是违法的，即使支付了加班费。

2. 综合计算工时工作制：

   • 适用于交通、铁路、邮电等特殊行业需连续作业的职工，以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，但平均日工作时间和周工作时间应与法定标准基本相同。
   • 判断：若用人单位实行的12小时工作制是经过审批的综合计算工时工作制，且在综合计算周期内劳动者的总工作时间不超过法定标准工作时间，则该工时安排合法。但超过部分需按加班处理并支付加班工资。

3. 不定时工作制：

   • 适用于因工作性质、特点或职责限制无法按标准工作时间衡量的职工，如高级管理人员、外勤人员等。
   • 判断：在不定时工作制下，上班12小时不一定违法，但需确保职工整体工作时间和休息权益得到保障，且加班费的支付需符合当地规定。

二、加班费的规定与计算

无论哪种工时制度，加班费的支付都是必须的，且需符合以下规定：

1. 标准工时制：
   • 工作日加班：支付不低于工资的150%的工资报酬。
   • 休息日加班且不能安排补休：支付不低于工资的200%的工资报酬。
   • 法定休假日加班：支付不低于工资的300%的工资报酬。

计算公式（以工作日加班为例）：

• 日工资 = 月工资 ÷ 21.75（月计薪天数）
• 小时工资 = 日工资 ÷ 8
• 加班工资 = 小时工资 × 加班小时数 × 150%

举例：若劳动者月工资为5000元，在工作日加班4小时（原工作8小时，现工作12小时），其加班工资计算如下：

• 日工资 ≈ 5000 ÷ 21.75 ≈ 229.89元
• 小时工资 ≈ 229.89 ÷ 8 ≈ 28.74元
• 加班工资 = 28.74 × 4 × 150% = 172.44元

1. 综合计算工时工作制：

   • 在综合计算周期内，总实际工作时间超过总法定标准工作时间的部分，视为延长工作时间，支付不低于工资的150%的加班工资。
   • 若在法定休假日安排工作，支付不低于工资的300%的加班工资。

2. 不定时工作制：

   • 一般情况下，不实行标准的加班工资规定。
   • 但部分地区规定，在法定休假日工作的，需按照不低于工资的300%支付加班工资，具体参照当地规定执行。

三、劳动者权益保护与建议

• 权益保护：如果用人单位违反规定强制劳动者加班，或安排加班不支付加班费，劳动者有权拒绝，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自身合法权益。
• 建议：劳动者应了解自身权益，保留好相关证据（如考勤记录、工资条等），以便在维权时提供有力支持。同时，用人单位也应严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到保障。

总结：给了加班费并不意味着每天工作12小时就一定合法。这需根据具体的工时制度及是否经过劳动行政部门的审批来判断。在任何情况下，用人单位都应严格遵守劳动法的规定，确保劳动者的合法权益得到保障。如果您有进一步的法律问题或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。