结论：员工离职停保原因选“员工主动离职”是否合法，需根据实际情况判断。若员工确实是主动离职，则选择该原因合法；若员工并非主动离职，而是因公司原因离职，则选择该原因不合法，且可能引发法律风险。

详细分析：

1. 员工主动离职的情况：

   • 如果员工确实是出于个人原因主动提出离职，并且按照公司规定的流程办理了离职手续，那么公司在停保时选择“员工主动离职”作为原因，是合法且合理的。
   • 在这种情况下，公司无需承担因员工离职而产生的额外法律责任，如经济补偿等。

2. 员工非主动离职的情况：

   • 如果员工并非主动离职，而是因公司原因（如公司裁员、未提供劳动条件、未及时支付劳动报酬等）被迫离职，那么公司在停保时选择“员工主动离职”作为原因，则是不合法的。
   • 这种行为可能构成对员工权益的侵害，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司承担相应的法律责任，如支付经济补偿、赔偿金等。

法律建议：

• 公司角度：

  • 在办理员工离职手续时，应确保与员工进行充分沟通，明确离职原因，并按照实际情况在停保时选择正确的离职原因。
  • 如果员工离职原因存在争议，建议公司保留相关证据（如离职申请、沟通记录等），以备不时之需。

• 员工角度：

  • 如果员工发现自己离职后，公司在停保时选择了不正确的离职原因，且该原因可能对自己产生不利影响（如影响再就业、领取失业保险等），员工有权向公司提出异议，并要求公司更正。
  • 如果公司拒绝更正，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果公司因选择错误的离职原因而侵害了员工的权益，公司可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。
• 同时，公司还可能因员工的投诉或仲裁而承担经济赔偿责任，包括支付经济补偿、赔偿金等。

总之，员工离职停保原因的选择应基于实际情况，确保合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。