结论前置：员工因患重大疾病，医疗期已满仍不能继续工作的，单位与员工解除劳动合同是否违法，需根据具体情况和法律法规综合判断。一般情况下，医疗期内用人单位不能解除劳动合同；医疗期届满后，若员工不能从事原工作且无法从事用人单位另行安排的工作，用人单位在符合法定条件、遵循法定程序并履行补偿义务的情况下，可以解除劳动合同，否则可能构成违法解除。

一、医疗期内不能解除劳动合同

• 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条第三项规定，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的，用人单位不得依照该法第四十条或第四十一条的规定解除劳动合同。这意味着，在医疗期内，无论员工病情如何，用人单位都无权单方面解除劳动合同。

• 医疗期的确定：医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。其长短根据劳动者的实际工作年限和在本单位的工作年限来确定。例如，实际工作年限十年以下且本单位工作年限五年以下为三个月，五年以上为六个月；实际工作年限十年以上且本单位工作年限五年以下为六个月，五年以上十年以下为九个月，以此类推。

二、医疗期届满后的处理

• 可以解除劳动合同的情况：

  • 无法从事原工作或另行安排的工作：根据《劳动合同法》第四十条第一款规定，医疗期满后，劳动者不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资后，可以解除劳动合同，并按规定支付经济补偿。
  • 存在严重过错：即便医疗期满，如果劳动者存在严重违反用人单位规章制度、严重失职、营私舞弊给用人单位造成重大损害等《劳动合同法》第三十九条规定的情形，用人单位可以解除劳动合同，且无需支付经济补偿。

• 不能解除劳动合同的情况：

  • 能够从事原工作或另行安排的工作：医疗期届满后，如果劳动者能够继续从事原工作或由用人单位另行安排的工作，用人单位不得以劳动者患病为由解除劳动合同，否则构成违法解除，需按《劳动合同法》第八十七条规定支付二倍经济补偿金作为赔偿金。

三、经济补偿与特殊补助

• 经济补偿金：若用人单位依法解除劳动合同，应按劳动者在本单位工作的年限支付经济补偿金。每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。

• 医疗补助费：根据相关规定，用人单位还应发给不低于六个月工资的医疗补助费。对于患重病和绝症的劳动者，分别加付50%和100%的医疗补助费。

四、特殊情况处理

• 职业病与工伤：对于患职业病或因工负伤并被确认丧失或部分丧失劳动能力的劳动者，用人单位不得依据医疗期满不能从事原工作为由解除劳动合同，而应按照国家有关工伤保险的规定支付工伤待遇。

• 劳动者的报到义务：医疗期满后第一天，劳动者应到单位报到上班，以便单位评估其工作能力。如未按时报到，可能被视为旷工，导致劳动合同被解除且无法获得经济补偿金。

五、综合建议

1. 对于用人单位：在处理涉及患病劳动者的劳动关系时，应严格遵守法律法规，确保程序的合法性和补偿的合理性。在解除劳动合同前，应充分评估劳动者的工作能力，并尝试为其另行安排合适的工作岗位。

2. 对于劳动者：应了解自身权益，及时与用人单位沟通工作安排和补偿事宜。若用人单位违反规定解除劳动合同或未依法支付经济补偿金和医疗补助费，可与用人单位协商解决；协商不成时，可向劳动监察部门投诉或向劳动争议仲裁机构申请仲裁。

综上所述，涉及重大疾病的劳动合同问题需结合具体法律法规和实际情况进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。