结论：在职员工年度绩效只发了一半，离职追溯时并不意味着只能要到一半，具体能否获得全额绩效需根据劳动合同、公司规章制度以及实际情况来判断。
分析如下：
劳动合同与规章制度：
- 首先，要查看劳动合同中是否有关于年度绩效发放的具体条款。如果合同中明确规定了年度绩效的发放方式和条件，那么公司应当按照合同约定来执行。
- 其次，要审查公司的规章制度。如果公司规章制度中有关于年度绩效发放的规定，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司也应当遵守这些规定。
绩效发放的实际情况：
- 如果年度绩效的发放是基于员工的工作表现、业绩等因素，且员工在离职前已经完成了相应的工作任务并达到了绩效标准，那么员工有权要求公司发放全额的年度绩效。
- 如果员工在离职前未完成相应的工作任务或未达到绩效标准，那么公司可能根据实际情况调整绩效发放金额。但这种情况需要公司有明确的绩效评估标准和流程，并且这些标准和流程需要事先告知员工并得到员工的认可。
离职追溯的权益：
- 员工离职后，如果发现公司在绩效发放上存在违法行为或未按照合同约定、规章制度执行，员工有权通过法律途径来维护自己的权益。
- 离职追溯时，员工可以要求公司补发未发放的绩效部分，并可能要求公司支付相应的利息或赔偿金（具体根据实际情况和法律法规来确定）。
建议：
- 如果您遇到这种情况，建议先与公司进行协商，了解公司未发放全额绩效的具体原因，并要求公司提供相应的证据和依据。
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 在整个过程中，建议您保留好相关的证据材料，如劳动合同、公司规章制度、绩效评估表等，以便在需要时提供证明。
可能涉及的法律后果：
- 如果公司未按照劳动合同或规章制度发放年度绩效，且无法提供合理的解释和证据，那么公司可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁的败诉风险。
- 员工在维护自己权益的过程中，如果采取合法手段且证据充分，那么有可能获得全额的年度绩效以及相应的利息或赔偿金。