结论：带薪休假两天但实际休了四天的情况下，应扣工资的天数取决于休假性质及公司规定。若超出带薪休假天数的部分为无薪事假，则应扣除超出天数的工资；若为病假且符合公司规定，则可能按病假工资标准扣除；若为年假或其他带薪假期，则通常不应扣工资。

详细分析：

1. 带薪休假与无薪事假的区分：

   • 带薪休假：通常指员工依法享有的、在休假期间工资照发的假期，如年假、法定节假日等。
   • 无薪事假：员工因个人原因需要请假，且该假期不属于带薪休假范畴的，公司有权扣除相应天数的工资。

2. 具体计算与考虑因素：

   • 若超出带薪休假天数的部分为无薪事假：

     • 首先，确定员工的基本工资和月计薪天数（通常为21.75天）。
     • 计算日工资：日工资 = 基本工资 ÷ 月计薪天数。
     • 计算应扣工资：应扣工资 = 日工资 × 超出带薪休假天数的请假天数。
     • 示例：假设员工基本工资为5000元，月计薪天数为21.75天，带薪休假为2天，实际休假4天，超出2天为无薪事假。则日工资约为229.89元（5000元 ÷ 21.75天），应扣工资为459.78元（229.89元 × 2天）。

   • 若超出带薪休假天数的部分为病假：

     • 根据公司规定和法律法规，病假工资可能不低于最低工资标准的80%。
     • 计算病假工资时，需先确定最低工资标准，再按比例计算。
     • 示例：假设最低工资标准为2000元/月，病假工资为最低工资标准的80%，则病假日工资约为73.56元（2000元/月 ÷ 21.75天 × 80%），若病假2天，则病假工资为147.12元，实际应扣工资为基本工资减去病假工资。

   • 若超出带薪休假天数的部分为年假或其他带薪假期：

     • 通常情况下，年假或其他带薪假期不应扣工资。
     • 但若公司有特殊规定，且该规定不违反法律法规，则需按公司规定执行。

3. 注意事项：

   • 查阅公司规定：员工应仔细查阅公司规章制度，了解请假扣款的具体规定。
   • 保留证据：员工应妥善保存请假条、工资条等相关证据，以备不时之需。
   • 及时沟通：若对扣款有疑问，员工应及时与公司人事部门沟通，确保自身权益不受侵害。

总结：带薪休假两天但实际休了四天的情况下，应扣工资的天数及金额取决于休假性质及公司规定。员工应了解自己的权益和公司规定，确保在请假时做出合理的选择，并在必要时与公司进行沟通以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。