当员工在厂里上班受伤，但公司不配合走工伤流程时，您确实会面临一些挑战，但别担心，以下是一些清晰、详细且有深度的建议，帮助您维护自己的合法权益：

一、明确工伤认定条件与流程

首先，您需要了解工伤认定的基本条件。根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的，应当被认定为工伤。工伤认定的流程通常包括申请、受理、审核和决定等环节。

二、自行准备并提交工伤认定申请

1. 准备材料：

   • 工伤认定申请表：详细填写事故发生的时间、地点、原因及伤害程度等。
   • 劳动关系证明：如劳动合同、工资支付记录、考勤记录等，以证明您与用人单位存在劳动关系。若公司拒绝提供，您可以通过劳动仲裁确认劳动关系，或利用银行流水、工作证、同事证言等证据来佐证。
   • 医疗诊断证明：由正规医疗机构出具，证明您的伤情及治疗情况。

2. 提交申请：

   • 时间限制：请务必注意，职工发生事故伤害后，所在单位应在30日内提出工伤认定申请。若单位未按规定申请，您或您的近亲属可在1年内直接向社会保险行政部门（通常是人力资源和社会保障局）提出申请。
   • 申请途径：携带准备好的材料，前往当地社会保险行政部门提交工伤认定申请。

三、应对公司不配合的情况

1. 收集证据：

   • 保存与公司沟通协商的记录，如邮件、短信等，这些将作为后续维权的依据。
   • 若公司拒绝提供必要材料或配合，您可以通过法律途径要求其提供，或利用其他证据来证明劳动关系和工伤事实。

2. 法律救济途径：

   • 行政复议/诉讼：若工伤认定申请被驳回，您有权依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
   • 劳动监察投诉：向当地劳动监察部门举报公司的不配合行为，要求其督促公司整改并配合工伤认定流程。
   • 法律援助：若您经济困难，可以申请法律援助，获取专业律师的支持和帮助。

四、后续权益保障

1. 劳动能力鉴定：

   • 经治疗伤情稳定后，您可向劳动能力鉴定委员会申请伤残等级鉴定，这将作为您后续主张赔偿的依据。

2. 主张工伤待遇：

   • 根据鉴定结果，您有权向公司或社保基金主张医疗费、停工留薪期工资、一次性伤残补助金等法定待遇。

3. 解除合同补偿：

   • 若您的伤情构成伤残，且您希望解除劳动合同，您可依据《劳动合同法》的相关规定，要求公司支付经济补偿金。

五、特别提醒

• 在整个过程中，请务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。
• 与公司沟通时，尽量保留书面记录或录音等证据，以备不时之需。
• 若您对法律程序不熟悉或感到困惑，建议及时咨询专业律师或法律援助机构，以获取更具体的指导和帮助。

希望以上建议能对您有所帮助。在维护自己合法权益的同时，也请保持耐心和信心，相信法律会给您一个公正的答复。