针对您提出的“执业药师离职盖的是门店的章还是公司的章”这一问题，以下是我的详细解答：
在执业药师离职的过程中，关于盖章的问题，主要取决于您离职时所需办理的具体手续以及您所在单位的组织架构和管理规定。
如果门店具有独立法人资格：
- 在这种情况下，门店通常拥有自己的公章，并且能够独立承担法律责任。
- 如果您离职时需要办理相关手续（如离职证明、工作交接单等），并且这些手续需要加盖公章以确认其法律效力，那么您应该加盖门店的公章。
如果门店不具有独立法人资格，而是公司的一个分支机构：
- 在这种情况下，门店可能没有自己的公章，或者其公章的使用受到公司的严格限制。
- 您离职时所需办理的相关手续，可能需要加盖公司的公章以确认其法律效力。
- 此外，如果公司有明确规定，要求所有分支机构的离职手续必须加盖公司公章，那么您也应该遵循这一规定。
一般性建议：
- 在离职前，建议您先与门店或公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解离职手续的具体要求和流程。
- 询问是否需要加盖公章，以及应该加盖哪个公章（门店章还是公司章）。
- 根据沟通结果，准备相应的离职材料，并按照要求加盖公章。
特殊情况处理：
- 如果原备案单位（如门店）已经注销，无法提供离职证明或公章，您可以写一份个人离职声明，并本人签名后上传或提交给相关部门作为证明。
综上所述，执业药师离职时应该盖门店的章还是公司的章，并没有一个固定的答案。它取决于门店的法律地位、公司的管理规定以及离职手续的具体要求。因此，在离职前，建议您与相关部门进行充分沟通，以确保离职手续的顺利进行。