如果发现公司在劳动合同上做了手脚，这属于违法行为，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
仔细审查合同内容：
- 首先，要冷静下来，仔细审查劳动合同的每一项条款，特别是那些可能被篡改或添加的部分。对比你手中的合同副本与公司提供的原始版本（如果有的话），看是否存在不一致之处。
- 留意合同中的关键条款，如工作内容、工作地点、工作时间、薪资待遇、福利待遇、违约责任等，这些条款往往容易被动手脚。
收集证据：
- 保留好你手中的劳动合同副本，这是最直接的证据。
- 如果可能的话，收集其他相关证据，如入职通知、薪资单、工作记录、同事证言等，这些都可以作为辅助证据来证明公司的不当行为。
- 如果发现合同被篡改，可以尝试通过技术手段（如文件时间戳、版本对比等）来证明篡改的事实。
与公司协商：
- 在掌握了足够的证据后，可以尝试与公司进行协商，要求公司纠正不当行为，如恢复合同原状、赔偿损失等。
- 协商过程中要保持冷静和理性，明确表达自己的诉求和依据，避免情绪化的争执。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉公司的违法行为。
- 投诉时需要提供详细的证据和情况说明，劳动监察部门会依法进行调查处理。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果劳动监察部门的处理结果不能满足你的诉求，或者公司拒绝配合调查处理，你可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
- 对仲裁结果不服的，还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。
在处理此类问题时，有几点需要特别注意：
- 保持冷静和理性，不要因为情绪激动而做出冲动的行为。
- 及时收集证据，确保证据的完整性和有效性。
- 了解并熟悉相关的法律法规和政策，以便更好地维护自己的权益。
- 如果对法律程序不熟悉或者感到困惑，可以随时向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。