针对员工故意扰乱公司正常工作秩序的情况，公司可以采取以下应对措施：

1. 依据公司规章制度处理：

   • 规章制度的重要性：公司应首先确保有完善的规章制度，明确规定员工扰乱工作秩序的行为标准及相应的处罚措施。这是处理此类问题的法律依据和内部准则。
   • 具体处理措施：根据规章制度的条款，对扰乱秩序的员工进行警告、罚款、降职降薪或解除劳动合同等处罚。在实施处罚时，务必确保程序合法，如提前通知员工、给予其申辩机会等，以避免因程序不当而引发的法律纠纷。

2. 收集证据并报警：

   • 证据收集：公司应积极收集员工扰乱工作秩序的证据，如监控录像、同事证言、书面记录等。这些证据在后续的法律程序中至关重要，能够证明员工的违法行为和公司的损失。
   • 报警处理：若员工的扰乱行为严重到构成违法犯罪（如寻衅滋事、破坏生产经营等），公司应立即向公安机关报案，由公安机关依法处理。

3. 通过劳动仲裁或诉讼解决：

   • 劳动仲裁：若员工的行为违反了劳动合同或公司规章制度，但尚未构成违法犯罪，公司可以向劳动仲裁委员会申请仲裁，要求员工承担相应的法律责任，如赔偿损失、恢复名誉等。
   • 诉讼途径：若劳动仲裁结果不满意或员工拒不执行仲裁裁决，公司可以向人民法院提起诉讼，通过司法程序维护自身权益。

4. 加强预防和管理：

   • 员工培训：公司应定期对员工进行法律法规和职业道德培训，提高员工的法律意识和职业素养，减少类似事件的发生。
   • 建立沟通机制：建立有效的员工沟通机制，及时了解员工的思想动态和工作需求，解决员工在工作中遇到的问题和困难，从而预防员工因不满而采取扰乱秩序的行为。

在处理此类问题时，公司还需注意以下法律后果：

• 若公司处理不当或程序违法，可能面临员工提起的劳动仲裁或诉讼，要求公司承担违法解除劳动合同、支付赔偿金等法律责任。
• 若员工的扰乱行为构成违法犯罪，公司虽可报警处理，但也可能因管理不善而承担一定的管理责任。

建议：公司在处理员工故意扰乱工作秩序的问题时，应坚持依法依规、程序正当的原则，既要维护公司的正常运营秩序，又要保障员工的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。