结论：公司以迟到补卡钻公司漏洞为理由扣绩效是否合理，需分情况讨论，不能一概而论。
分析如下：
公司规章制度合法性角度：
- 如果公司的规章制度中明确规定了迟到补卡属于违反公司规定的行为，并且该规章制度是经过民主程序制定、公示或告知劳动者的，同时内容不违反法律、行政法规及政策规定，那么公司依据此规章制度扣绩效可能是合理的。
- 反之，如果公司的规章制度未明确规定迟到补卡为违规行为，或者规章制度制定程序不合法、内容违法，那么公司以此为由扣绩效则缺乏合法依据，是不合理的。
扣绩效的合理性角度：
- 即使公司的规章制度中规定了迟到补卡为违规行为，但公司在扣绩效时也需要考虑扣减的幅度是否合理。如果扣减的绩效过多，超出了劳动者因迟到补卡行为给公司造成的实际损失，那么这种扣减可能被视为不合理。
- 另外，公司还需要证明劳动者的迟到补卡行为确实给公司造成了损失，或者该行为违反了公司的正常管理秩序，否则公司无权随意扣减绩效。
劳动者权益保护角度：
- 劳动者有权了解公司的规章制度，并在遵守规章制度的前提下享受劳动权益。如果公司以不合理的理由扣减绩效，劳动者有权向公司提出异议，并要求公司给出合理的解释和依据。
- 如果公司拒绝解释或给出的解释不合理，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
建议：
- 对于劳动者而言，如果公司以迟到补卡钻公司漏洞为理由扣绩效，首先应当查看公司的规章制度，确认该规定是否合法有效。如果认为公司的扣减行为不合理，可以与公司进行沟通协商，要求公司给出合理的解释和依据。如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于公司而言，应当制定合法有效的规章制度，并明确规定各种违规行为的处理方式和扣减绩效的幅度。在处理劳动者违规行为时，应当遵循公平、公正、合理的原则，确保扣减的绩效与劳动者的违规行为给公司造成的实际损失相匹配。
可能后果：
- 如果公司扣减绩效的行为被认定为不合理或违法，那么公司可能需要承担补发绩效、支付赔偿金等法律责任。
- 如果劳动者因公司的不合理扣减行为而离职，公司还可能需要支付经济补偿金等费用。
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