针对您提出的“员工请假3个月不批是否可以通知员工办理离职”的问题，这并非一个简单的“可以”或“不可以”的回答，而是需要依据具体的法律法规和实际情况来综合判断。
首先，我们要明确的是，员工请假未获批并不直接等同于员工可以主动离职，或者公司可以单方面解除劳动合同。根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同需要满足一定的法定条件，并且通常需要提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资。
对于您提到的员工请假3个月不批的情况，我们需要考虑以下几个方面：
请假的合理性和必要性：员工提出的请假请求是否合理且必要，比如是否因为患病、非因工负伤需要长期治疗，或者家庭有特殊情况需要照顾等。如果员工的请假请求具有合理性和必要性，用人单位应当予以考虑，并在合理范围内给予批准。
公司的规章制度：公司是否有明确的规章制度关于员工请假的流程、审批权限以及未获批的处理方式等。如果公司有相关规定，并且员工在请假时已经知晓并同意遵守，那么公司可以按照规章制度来处理。但需要注意的是，公司的规章制度不能违反法律法规的强制性规定。
劳动合同的约定：劳动合同中是否有关于员工请假的特别约定。如果劳动合同中有明确约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应当按照劳动合同的约定来履行。
员工的行为：如果员工在请假未获批的情况下擅自离岗，这并不意味着公司可以直接认定员工为主动离职。根据相关法律法规和司法实践，擅自离岗并不一定导致劳动关系的中断。公司应当通过合法途径与员工沟通，了解员工离岗的原因，并尝试协商解决。
法定解除条件：如果员工确实存在不能胜任工作、严重违反公司规章制度等法定解除劳动合同的情形，公司可以依法解除劳动合同。但在此之前，公司需要确保已经履行了相应的法定程序，比如提前通知、支付经济补偿等。
综上所述，对于员工请假3个月不批的情况，公司不能直接通知员工办理离职。公司应当首先与员工进行沟通，了解请假的原因和必要性，并尝试在合理范围内给予批准或协商解决方案。如果员工确实存在不能胜任工作等法定解除劳动合同的情形，公司可以依法解除劳动合同，但需要确保已经履行了相应的法定程序。
因此，我建议您在处理此类问题时，务必谨慎对待，遵循法律法规和公司的规章制度，通过合法途径与员工进行沟通协商，以维护双方的合法权益和构建和谐的劳资关系。