针对您提出的“单方面克扣员工基础绩效工资，这个补发是否能主张赔偿金”的问题，结论是：在符合一定条件下，员工不仅可以主张补发被克扣的基础绩效工资，还可以进一步主张赔偿金。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律基础与原则
《中华人民共和国劳动法》与《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定：
- 根据《劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《劳动合同法》第三十八条也明确规定，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同，并有权要求用人单位支付经济补偿。
绩效工资的性质：
- 绩效工资通常作为员工劳动报酬的一部分，与员工的工作表现、业绩等挂钩。但基础绩效工资，若已明确为员工应得的一部分，则属于劳动报酬的范畴，用人单位不得随意克扣。
二、主张补发工资与赔偿金的条件
补发工资的条件：
- 员工需证明用人单位存在单方面克扣基础绩效工资的行为。这通常可以通过工资条、银行转账记录、与用人单位的沟通记录等证据来证明。
- 员工需证明被克扣的工资属于其应得的基础绩效工资部分，而非因个人原因（如违纪、未完成工作任务等）应扣除的部分。
主张赔偿金的条件：
- 在用人单位存在违法克扣工资的行为，且该行为导致员工解除劳动合同的情况下，员工有权要求用人单位支付经济补偿（即赔偿金的一种形式）。
- 经济补偿的计算标准通常根据员工在用人单位的工作年限、月工资等因素确定。具体计算公式为：经济补偿 = 工作年限 × 月工资（月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资）。
- 若用人单位的克扣工资行为情节严重，如恶意拖欠、拒不支付等，员工还可以考虑向劳动行政部门投诉，要求用人单位支付赔偿金（该赔偿金与经济补偿不同，通常具有惩罚性）。
三、实际操作建议
收集证据：
- 员工应妥善保存与工资相关的所有证据，包括工资条、银行转账记录、与用人单位的沟通记录等。
- 若可能，还可以收集同事的证言或其他相关证据，以证明用人单位存在克扣工资的行为。
与用人单位协商：
- 在掌握充分证据后，员工可以尝试与用人单位进行协商，要求补发被克扣的工资并支付相应的赔偿金。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若协商无果，员工可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求用人单位补发工资并支付赔偿金。
- 对劳动仲裁结果不服的，员工还可以向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、注意事项
- 员工在主张权利时，应注意保留好所有相关证据，并确保证据的真实性和合法性。
- 在与用人单位协商或申请劳动仲裁、提起诉讼时，员工可以寻求专业律师的帮助，以提高维权效率和成功率。
综上所述，若用人单位单方面克扣员工的基础绩效工资，员工在符合一定条件下不仅可以主张补发工资，还可以进一步主张赔偿金。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。