结论：单位要求综合工时制下已工作44小时的员工请48小时年假，这一行为是否违法需分情况讨论，但在多数情况下，该行为可能涉嫌违法或不合理，具体分析如下：
一、综合工时制下的工作时间与年假关系
综合工时制的特点：
- 综合工时制是指用人单位因生产特点不能实行标准工时制，而经劳动行政部门批准，对特定岗位实行以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。
- 在综合工时制下，员工的工作时间可以在一定周期内灵活安排，但平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
年假的安排：
- 年假是员工依法享有的带薪休假权利，其长度通常根据员工的工作年限确定。
- 单位在安排员工年假时，应考虑员工的工作实际情况和个人意愿，尽量在不影响工作的情况下合理安排。
二、单位要求请年假的合法性分析
若员工已工作44小时未超周期总工时：
- 如果在一个综合计算周期内（如周、月、季、年），员工已工作的44小时并未超过该周期内的总工时限制，那么单位要求员工请48小时年假可能缺乏合理性。因为此时员工并未达到需要休息的程度，且年假的安排应基于员工的实际需求和单位的运营情况。
若员工已工作44小时已接近或超周期总工时：
- 如果员工已工作的44小时已经接近或超过了一个综合计算周期内的总工时限制，那么单位要求员工请年假可能是出于保障员工休息权的考虑。然而，即使如此，单位也应与员工协商确定年假的具体时间，而不是单方面要求员工请48小时年假。因为年假的安排应尊重员工的个人意愿和实际情况。
年假长度的合理性：
- 48小时年假相当于6个工作日（假设每日工作8小时），这一长度可能超过了一般员工的年假长度。除非员工的工作年限较长或单位有特殊规定，否则单位要求员工请如此长的年假可能缺乏合理性。
三、可能的法律后果与建议
法律后果：
- 如果单位的行为违反了劳动法律法规关于工时、休假等方面的规定，员工有权向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，要求单位纠正违法行为并赔偿损失。
建议：
- 对于员工：如果认为单位的要求不合理或违法，可以与单位进行协商沟通，表达自己的意见和需求。如果协商无果，可以向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于单位：应尊重员工的休息权和年假权利，合理安排员工的工作时间和休假时间。在要求员工请年假时，应与员工充分协商并达成一致意见，避免单方面强制要求员工请年假。
总结：单位要求综合工时制下已工作44小时的员工请48小时年假，这一行为在多数情况下可能涉嫌违法或不合理。员工和单位应共同遵守劳动法律法规的规定，合理安排工作时间和休假时间，以维护双方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。