员工对加班费有异议，应首先向用人公司提出。以下是对此问题的详细分析：
一、用人公司与用工公司的区别与联系
在劳动关系中，用人公司通常指的是与员工签订劳动合同，直接雇佣员工并支付工资、福利等劳动报酬的实体。而用工公司则可能指的是实际使用员工劳动力的单位，这种情况多见于劳务派遣、借调等特殊劳动关系中。在大多数常规劳动关系中，用人公司与用工公司是同一主体。
二、加班费异议的提出对象
常规劳动关系：
- 在常规劳动关系中，员工与用人公司签订劳动合同，加班费作为劳动报酬的一部分，应由用人公司支付。因此，员工对加班费有异议时，应直接向用人公司提出，要求其核实并支付应得的加班费。
特殊劳动关系（如劳务派遣）：
- 在劳务派遣等特殊劳动关系中，虽然员工可能与劳务派遣公司（用人公司）签订劳动合同，但实际工作可能在另一家单位（用工公司）进行。然而，根据《劳动合同法》等相关法律法规，劳务派遣公司作为用人公司，仍应承担支付加班费等劳动报酬的责任。因此，即使在这种情况下，员工对加班费有异议时，也应首先向劳务派遣公司（用人公司）提出。
- 如果用工公司存在未按照约定支付加班费等违法行为，员工也可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，但投诉或仲裁的对象仍应包括劳务派遣公司（用人公司），因为其是劳动合同的签订方和劳动报酬的支付方。
三、提出加班费异议的建议
收集证据：
- 员工在提出加班费异议前，应收集相关证据，如加班记录、工资条、劳动合同等，以证明自己存在加班事实且未获得相应加班费。
与用人公司协商：
- 员工应首先尝试与用人公司进行协商，明确表达自己的诉求和理由，要求用人公司核实并支付应得的加班费。
寻求法律援助：
- 如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在此过程中，员工可以寻求专业律师的帮助，以提高维权效率。
四、法律后果
如果用人公司未按照法律法规和劳动合同约定支付加班费，员工有权要求其支付拖欠的加班费及相应的经济补偿。同时，用人公司还可能面临劳动监察部门的处罚和劳动仲裁机构的裁决，承担相应的法律责任。
综上所述，员工对加班费有异议时，应首先向用人公司提出。在特殊劳动关系中，虽然用工公司可能实际使用员工的劳动力，但用人公司仍应承担支付加班费等劳动报酬的责任。员工在提出异议时，应收集相关证据，与用人公司协商，并在必要时寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。