面对钱已经还了但对方不承认的情况，你可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
收集并保留还款证据：
- 电子转账记录：如果你通过银行转账、微信、支付宝等电子支付方式还款，务必保存好转账凭证和交易记录。这些记录能清晰显示转账的时间、金额、收款方等信息，是强有力的直接证据。
- 书面证据：如果是现金还款，应要求对方出具收据或收条，并确保其上明确写明收款人、收款时间、收款金额及款项性质（如“收到XX还款”等）。若在原借条上标注“已还款”并让对方签字确认，同样有效。
- 聊天记录或通话录音：双方关于还款事宜的聊天记录（如微信、短信）或通话录音也可作为辅助证据。但需确保聊天记录完整，录音真实且未采用违法手段获取。
- 证人证言：如有第三人在场见证还款过程，其证言也能提供有力支持。证人需能清晰描述还款的时间、地点、金额等情况。
- 银行取款凭证：如果你从银行取款后以现金方式还款，可以提供取款凭证来证明资金来源。
与对方友好协商：
- 在收集好证据后，首先尝试与对方进行友好协商，展示你的还款证据，并说明情况，争取让对方承认还款事实。协商过程中，可以录音录像，以备不时之需。
寻求第三方调解：
- 若协商无果，可向当地的人民调解委员会或其他相关机构（如行业协会、商会）申请调解。调解员将依据事实和法律进行公正调解，促使双方达成和解协议。调解达成的协议具有法律效力，双方应当履行。
采取法律措施：
- 发送催款确认函或律师函：若调解无效，可考虑向对方发送催款确认函或委托我起草并发送律师函。这不仅能以专业的法律语言告知对方你的主张和证据，还能起到一定的威慑作用，督促对方尽快解决问题。
- 提起诉讼：若上述方式均无法解决问题，可向法院提起民事诉讼，请求法院确认债务已经清偿。在诉讼过程中，需向法院提交之前收集的所有证据材料，并由法院根据事实和法律规定作出公正判决。
- 准备诉讼材料：包括起诉状、证据清单及证据材料、双方的身份信息等。起诉状要明确诉讼请求和事实理由。
- 选择管辖法院：一般由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。需根据具体情况选择合适的法院进行起诉。
- 参加庭审：在庭审过程中，按照法官的要求进行陈述和举证，清晰地阐述还款的事实和提供相关证据。
在处理此类纠纷时，还需注意以下几点：
- 诉讼时效：民事案件的诉讼时效一般为三年。请务必在发现对方不承认还款时及时采取行动，以免面临败诉风险。
- 证据效力：确保证据的合法性、真实性和关联性。非法获取的证据可能不被法院采纳。
- 保持冷静和理性：在处理此类纠纷时，应避免采取过激行为或言语攻击，以免激化矛盾。
示例说明：
假设你通过微信转账方式向朋友还款，但朋友后来否认还款事实。此时，你可以保存微信转账记录作为直接证据，并与朋友进行友好协商，展示转账记录并说明情况。如果协商无果，你可以向人民调解委员会申请调解，或者委托我起草并发送律师函给朋友。若朋友仍然拒绝承认还款，你可以向法院提起诉讼，并提交微信转账记录作为证据。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。