面对欠款已结清但对方不承认的情况，你可以通过以下步骤来维护自己的合法权益：
收集并整理还款证据：
- 电子转账记录：如果你通过银行转账、微信、支付宝等第三方支付平台进行了还款，务必保存好这些转账记录。这些记录应包含转账时间、金额、收款方信息等，是证明你还款事实的直接证据。
- 书面证据：如果你还款时对方出具了收据，或者你在原借条上标注了“已还款”并让对方签字确认，这些书面证据同样具有法律效力。
- 聊天记录与通话录音：如果你与对方有过关于还款的聊天记录或通话录音，且其中清晰提及了还款事宜，这些也可以作为辅助证据。但请注意，录音需合法取得，不得侵犯他人隐私。
与对方进行友好协商：
- 在掌握充分证据的基础上，你可以尝试与对方进行友好协商。出示你的还款证据，并提醒对方回忆还款事实。在协商过程中，你可以录音录像，以备不时之需。
寻求第三方调解：
- 如果协商无果，你可以寻求人民调解委员会或其他相关机构（如行业协会、商会）的调解。调解员将依据事实和法律进行公正调解，促使双方达成和解。
提起诉讼：
- 当调解无法解决问题时，你可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在准备起诉状时，你需要详细陈述诉讼请求、事实和理由，并附上相关证据材料。
- 法院立案后，将安排庭审。在庭审中，你需要举证、质证、辩论，以证明自己已还款的事实。如果法院判决你胜诉，而对方不履行判决，你可以申请强制执行，以确保自身权益得到最终实现。
在处理此类纠纷时，你还需要注意以下几点：
- 保持冷静和理性：避免采取过激行为或言语攻击，以免激化矛盾。
- 确保证据的真实性、合法性和关联性：证据是解决问题的关键，务必确保证据的真实可靠。
- 及时咨询法律专业人士：虽然我在这里为你提供了一些建议，但每个案件的具体情况都有所不同。如果你在处理过程中遇到复杂情况或不确定如何操作，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律建议。
举例说明：
假设你通过微信转账向对方还款，并保存了转账记录。同时，你还保留了与对方的聊天记录，其中对方明确表示收到了还款。在这种情况下，你可以先尝试与对方协商，出示转账记录和聊天记录作为证据。如果对方仍然不承认，你可以寻求人民调解委员会的调解。如果调解无果，你可以向法院提起诉讼，并附上转账记录和聊天记录作为证据。法院将根据这些证据进行审理，并作出公正判决。