结论：公司因员工就餐未排队直接扣钱的行为是否合法，需结合具体情况判断，一般可能涉及违法，但若符合法定程序和条件也可能合法。以下分情况详细说明：

1. 若公司规章制度未明确规定就餐排队及相应处罚措施
   • 从法律层面看，公司直接扣钱缺乏依据。根据《劳动合同法》第四条规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。并且要将规章制度公示或者告知劳动者。
   • 如果公司没有通过上述民主程序制定关于就餐排队及扣钱的规章制度，也没有将相关内容告知员工，那么公司以员工就餐未排队为由扣钱就属于违法行为。员工有权要求公司返还被扣除的款项，若公司拒绝，员工可以向劳动监察部门投诉，劳动监察部门会责令公司改正，若给员工造成损失的，公司还需承担赔偿责任。
2. 若公司规章制度明确规定了就餐排队及相应处罚措施，且该制度合法有效
   • 首先，该规章制度要符合前面提到的民主程序制定和公示告知的要求。其次，处罚措施要合理合法。根据《工资支付暂行规定》第十六条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 如果公司规章制度中规定的因就餐未排队扣钱属于对员工违反劳动纪律的一种合理处罚，且扣除的金额在上述法律规定的范围内，那么公司的扣钱行为可能是合法的。但即便如此，公司也应当保留员工就餐未排队的相关证据，如监控录像、证人证言等，以证明员工确实存在违反规章制度的行为。
   • 如果公司扣除的金额超过了法定标准，或者没有证据证明员工存在违反规章制度的行为，那么公司的扣钱行为仍然是违法的，员工同样可以要求公司返还被扣除的款项，并向劳动监察部门投诉。

建议：如果公司存在这种扣钱行为，员工可以先与公司沟通协商，要求公司说明扣钱的依据和理由，并查看公司的相关规章制度。如果认为公司的行为违法，可以向当地的劳动监察部门投诉，也可以申请劳动仲裁维护自己的合法权益。如果公司是员工一方，要确保规章制度合法有效，处罚合理适度，并保留好相关证据。若还有其他疑问，欢迎继续向我咨询。