结论：项目提成若被认定为计件工资的一种形式，在符合法定条件的情况下，员工在项目中申请加班费是合理的。
分析：
项目提成与计件工资的关系：
- 计件工资是按照劳动者生产的合格品的数量（或作业量）和预先规定的计件单价来计算工资的一种形式。
- 项目提成，如果其计算方式是基于员工完成的项目数量或项目成果，且这种计算方式与计件工资的原理相似，即多劳多得，那么项目提成可以被视为计件工资的一种特殊形式。
加班费的法律规定：
- 根据《劳动法》及相关规定，劳动者在法定工作时间以外工作的，用人单位应当支付加班费。
- 加班费的具体计算方式通常依据劳动者的基本工资和加班时间来确定。对于实行计件工资的劳动者，加班费计算可能涉及计件单价、加班工作量等因素。
项目提成员工申请加班费的合理性：
- 如果项目提成被认定为计件工资，那么员工在项目中加班完成更多工作量，理应获得相应的加班费。
- 加班费的支付不仅是对员工额外劳动的补偿，也是用人单位遵守劳动法律法规的体现。
特殊情况考虑：
- 如果项目提成的计算方式并非单纯基于工作量，而是包含了其他因素（如项目利润、团队贡献等），那么加班费的计算可能更为复杂。
- 在某些情况下，用人单位可能与员工在劳动合同或项目合同中约定了提成和加班费的具体支付方式，这些约定应合法且公平。
建议：
对于员工：
- 在申请加班费前，应明确自己的工资结构，确认项目提成是否被视为计件工资。
- 保留加班工作的相关证据，如加班记录、项目完成情况等，以便在申请加班费时提供证明。
- 如果与用人单位在加班费支付上存在争议，可以寻求劳动仲裁或法律诉讼等途径解决。
对于用人单位：
- 应明确工资结构，确保项目提成的计算方式合法且透明。
- 在劳动合同或项目合同中明确约定提成和加班费的支付方式，避免后续争议。
- 遵守劳动法律法规，按时足额支付员工加班费。
可能后果：
- 如果用人单位未依法支付加班费，员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付加班费及可能的赔偿金。
- 长期未支付加班费可能影响用人单位的声誉和员工关系，甚至可能引发法律纠纷和行政处罚。
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