商铺收取卫生费是否合法，需根据具体情况判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
合同约定角度：
- 如果商铺业主与物业公司签订的物业服务合同中，明确约定了物业费中包含卫生清洁等相关服务费用，那么物业公司不应再额外收取卫生费。
- 若合同中约定了针对特定卫生服务项目（如垃圾清运费、定期消毒费等）可单独收取费用，并详细说明了收费标准及方式，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么此类收费在符合合同约定的前提下是合法的。
物价部门审批角度：
- 物业公司收取卫生费需经过当地物价部门的审批，并获得相关的收费许可文件。这是确保收费合法性的重要一环。
- 如果物业公司已获得物价部门的核准，并按照规定的收费标准执行，那么其收费行为是合法的。
业主大会或业主委员会同意角度：
- 根据《民法典》的相关规定，小区或商铺区域的重大事项需由业主共同决定。
- 如果物业公司收取卫生费已经过商铺业主大会或业主委员会的讨论通过，并形成决议，同时收费的用途、标准等都已向业主公示，那么此类收费具备合法性基础。
不合法收费的情况：
- 如果物业服务合同中没有关于收取卫生费的约定，且未经物价部门审批以及业主大会或业主委员会同意，物业公司擅自收取卫生费，则此行为是不合法的。
- 在这种情况下，商铺业主有权拒绝支付，并可向相关部门（如房地产管理部门、物价部门等）投诉，要求物业公司纠正不合理的收费行为。
实际操作建议：
- 查询依据：商铺业主在面对物业公司收取卫生费时，应首先要求物业公司提供收费依据，包括合同、物价部门批文、业主大会或业主委员会决议等。
- 咨询确认：若对物业公司提供的收费依据存疑，可向当地房地产管理部门、物价部门等咨询确认，以了解物业公司收费的合法性。
- 维护权益：若发现物业公司存在不合法收费行为，商铺业主应及时向相关部门投诉，以维护自身合法权益。
综上所述，商铺收取卫生费的合法性需根据具体情况判断。在符合法律规定和程序的前提下，物业公司可以收取卫生费；但若未经许可且无约定，则物业公司的收费行为是不合法的。商铺业主应充分了解相关法律法规，积极维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。