商铺卫生费上门收费是否合法，需结合具体情况判断，但总体来说，只要收费主体、程序及标准合法，上门收费行为本身并不违法。以下从不同角度为您详细分析：

1. 收费主体合法性

• 物业公司：若商铺位于物业管理区域内，且物业服务合同中明确约定了卫生费（或保洁费）的收取条款，物业公司有权依据合同上门收费。此时，收费行为具有合同依据，合法有效。
• 环卫部门或政府授权机构：若卫生费由环卫部门或政府授权的机构收取（如城市管理综合执法部门），且收费行为符合地方性法规或政府规章的规定（如《城市市容和环境卫生管理条例》），则上门收费同样合法。
• 其他主体：若收费主体为无资质的个人或未获授权的机构，则收费行为可能涉嫌违法，商铺有权拒绝支付并投诉。

2. 收费程序合法性

• 事先告知：合法收费需事先向商铺明确告知收费项目、标准及依据（如通过公示、合同条款或书面通知）。若未履行告知义务，商铺可主张收费无效。
• 自愿支付：除法律明确规定的强制收费情形外（如特定行业的环保费），卫生费原则上应由商铺自愿支付。若收费方采取威胁、骚扰等手段强迫支付，则涉嫌违法。
• 票据提供：收费后应出具正规票据（如发票或收据），否则商铺有权拒绝支付并要求补开。

3. 收费标准合法性

• 合同约定：若收费标准在物业服务合同中明确约定，且未违反法律强制性规定（如价格法），则按合同执行。
• 政府指导价：若卫生费属于政府定价或指导价范围（如部分地区的环卫服务费），收费方需严格执行标准，不得擅自提高。
• 市场调节价：若收费标准由市场调节（如商业保洁服务费），需确保价格合理且透明，避免显失公平。

4. 特殊情形处理

• 争议解决：若商铺对收费合法性存疑，可要求收费方出示依据（如合同、政府文件或票据），或向当地物价部门、房管部门投诉。
• 拒付风险：若商铺无正当理由拒付合法卫生费，可能面临物业服务中断、行政处罚（如环卫费欠缴）或诉讼风险。

法律建议

1. 核实身份与依据：要求收费方出示工作证、授权文件及收费依据，避免向无资质人员支付。
2. 审查合同与标准：若为物业公司收费，需核对物业服务合同条款；若为政府收费，需确认是否符合地方性法规。
3. 保留证据：支付费用时要求开具票据，并保存好相关通知、合同等文件，以备维权之需。
4. 协商或投诉：若对收费有异议，可先与收费方协商；协商不成，可向相关部门投诉或通过法律途径解决。

总结：商铺卫生费上门收费的合法性取决于收费主体、程序及标准是否符合法律及合同约定。建议您根据实际情况核实上述要点，必要时咨询专业律师以维护自身权益。