超时加班并支付加班费，若超出法定限制或未遵循法定程序，仍然构成违法行为。以下是对此问题的详细分析：
一、合法的超时加班与加班费支付
支付标准符合法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，用人单位安排劳动者延长工作时间时，需按照高于正常工作时间工资的标准支付加班费。具体标准为：工作日延长工作时间，支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日工作且不能补休，支付不低于工资的200%的工资报酬；法定休假日工作，支付不低于工资的300%的工资报酬。
- 举例：若员工正常工作时间每小时工资为20元，工作日加班1小时，用人单位应支付至少30元的加班费，此情况合法。
加班时长符合法律限制且程序合法：
- 《劳动法》第四十一条规定，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，可延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；特殊情况下，保障劳动者身体健康的前提下，每日延长不得超过三小时，每月累计不得超过三十六小时。
- 举例：企业与工会及员工协商一致后，安排员工每日加班2小时，连续5天（共10小时），且依法支付加班费，此行为合法。
二、违法的超时加班情形
加班时长超过法定限制：
- 即便支付了加班费，若用人单位安排劳动者每月加班时间超过36小时，仍属违法行为。
- 举例：工厂长期安排员工每天加班4-5小时，导致月加班总时长远超36小时，即使按规定支付加班费，也违反了法律规定。
未遵循法定程序：
- 用人单位未经与工会和劳动者协商，擅自安排加班，即使事后支付加班费，也是违法的。
- 举例：公司未与员工协商，直接要求周末加班并支付加班费，侵犯了员工的休息权和协商权，属于违法行为。
三、特殊情况下的考量
特殊行业或岗位：
- 对于某些特殊行业或岗位（如医疗、交通、公共安全等），由于其工作性质的特殊性，可能需要实行不定时工作制或综合计算工时工作制。在这种情况下，超时加班的合法性需要根据相关法律法规和行业规定来判断。
劳动者同意：
- 虽然劳动者同意加班可以作为用人单位安排加班的一个条件，但并不能完全免除用人单位遵守法律规定的义务。例如，即使劳动者同意超时加班，用人单位仍然需要确保加班时间不超过法律规定的上限，并支付相应的加班费。
四、法律后果与建议
- 法律后果：根据《劳动保障监察条例》第二十五条，用人单位违反劳动保障法律、法规或者规章延长劳动者工作时间的，由劳动保障行政部门给予警告，责令限期改正，并可以按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准计算，处以罚款。
- 建议：各企业和雇主应严格遵守《劳动法》等相关法律法规，确保员工的合法权益得到充分保障。同时，建议企业在制定加班政策时，充分考虑员工的身心健康和工作生活平衡，以促进企业的可持续发展和员工的长期福祉。
总结来说，超时加班并支付加班费并非简单的“合法”或“违法”问题，而需根据具体情况判断。关键在于是否遵守了法律规定的加班时长限制和协商程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。