结论：对于停工留薪期工资差额问题，你可以选择先向劳动监察大队投诉，也可以直接申请劳动仲裁，两者并不冲突，且直接仲裁通常不会产生不利影响。以下是对这一问题的详细分析：

一、先找劳动监察大队

1. 作用：劳动监察大队是劳动行政部门的一部分，负责监督用人单位遵守劳动法律法规的情况。如果你认为用人单位在停工留薪期工资支付上存在问题，可以向劳动监察大队投诉，他们会进行调查，并根据调查结果对用人单位进行相应的处理，如责令支付工资差额、罚款等。

2. 优点：投诉流程相对简便，处理速度可能较快，且不需要支付仲裁费用。

3. 缺点：劳动监察大队的处理结果可能不具有强制执行力，如果用人单位不履行处理决定，你可能还需要通过其他途径（如申请劳动仲裁或提起诉讼）来维护自己的权益。

二、直接申请劳动仲裁

1. 作用：劳动仲裁是解决劳动争议的一种法定方式。如果你与用人单位在停工留薪期工资支付上存在争议，可以直接向劳动仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会会根据双方提供的证据和法律法规进行裁决，裁决结果具有强制执行力。

2. 优点：

   • 裁决结果具有法律约束力，用人单位必须履行。
   • 仲裁过程中，你可以充分陈述自己的诉求和理由，并提交相关证据。
   • 如果对仲裁结果不服，你还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。

3. 缺点：仲裁流程可能相对复杂，需要一定的时间和精力来准备和参与仲裁过程。同时，虽然仲裁本身不收费，但如果你需要聘请律师或进行其他法律活动，可能会产生一定的费用。

三、直接仲裁的影响

直接申请劳动仲裁通常不会对你产生不利影响。仲裁是解决劳动争议的一种合法、有效的方式，而且仲裁结果具有强制执行力。如果你选择直接仲裁，并且仲裁委员会支持了你的诉求，那么用人单位就必须按照裁决结果支付停工留薪期工资差额。

四、建议

1. 根据实际情况选择：你可以根据自己的实际情况和需求来选择先找劳动监察大队还是直接申请劳动仲裁。如果你希望尽快解决问题，且认为用人单位可能会配合劳动监察大队的调查和处理，那么可以先选择投诉；如果你认为用人单位可能不会配合，或者你希望获得一个具有强制执行力的裁决结果，那么可以直接申请仲裁。

2. 保留证据：无论你选择哪种方式，都需要保留好相关证据，如工资条、停工留薪期证明、与用人单位的沟通记录等。这些证据将有助于你证明自己的诉求和理由。

3. 咨询专业律师：如果你对劳动法律法规或仲裁流程不熟悉，或者遇到了复杂的劳动争议问题，可以向我咨询。我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。