结论：工伤认定结论已出后，用人单位一般不能另行起诉否认劳动关系，但在特定情况下，用人单位仍有机会通过法律途径对劳动关系提出异议。

分析说明：

1. 工伤认定结论的法律效力：

   • 工伤认定结论是由社会保险行政部门根据法定程序作出的，具有法律效力。一旦作出，即对用人单位和劳动者产生约束力。
   • 工伤认定结论中通常会明确劳动者与用人单位之间存在劳动关系，这是认定工伤的前提条件。

2. 用人单位否认劳动关系的途径：

   • 在工伤认定过程中提出异议：用人单位在收到工伤认定申请后，有权在规定时间内提出异议，并提供相关证据证明与劳动者之间不存在劳动关系。如果用人单位未在此阶段提出异议，通常视为认可劳动关系。
   • 行政复议或行政诉讼：虽然工伤认定结论作出后，用人单位一般不能直接起诉否认劳动关系，但如果用人单位认为工伤认定结论存在错误，如劳动关系认定错误，可以在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼，请求撤销或变更工伤认定结论。然而，这并不意味着用人单位可以直接否认劳动关系，而是需要通过审查工伤认定结论的合法性来间接影响劳动关系的认定。
   • 劳动争议仲裁或诉讼：如果用人单位与劳动者之间就劳动关系存在争议，且该争议未在工伤认定过程中得到解决，用人单位可以在劳动争议仲裁或诉讼中提出否认劳动关系的抗辩。但这种情况通常发生在工伤认定之前或工伤认定结论未明确涉及劳动关系的情况下。

3. 特定情况下的例外：

   • 如果工伤认定结论存在明显错误或违法情形，如程序违法、证据不足等，用人单位可能有机会通过法律途径请求撤销或变更该结论，并在此过程中对劳动关系提出异议。
   • 如果用人单位有新的证据证明与劳动者之间不存在劳动关系，且该证据在工伤认定过程中因故未能提供，用人单位也可以在后续的法律程序中提出该证据，并请求对劳动关系进行重新认定。

行动建议：

• 对于用人单位：如果对工伤认定结论中的劳动关系认定有异议，应在工伤认定过程中及时提出，并提供充分证据支持自己的观点。如果错过这一时机，应谨慎考虑是否通过行政复议、行政诉讼或劳动争议仲裁等途径提出异议，并评估相关风险和成本。
• 对于劳动者：如果收到用人单位对劳动关系的否认或质疑，应积极收集证据证明与用人单位之间存在劳动关系，如劳动合同、工资支付记录、工作证等。同时，可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和应对策略。

法律后果：

• 如果用人单位未经合法程序擅自否认劳动关系，并试图逃避工伤赔偿责任，可能面临法律制裁和声誉损失。
• 如果劳动者无法证明与用人单位之间存在劳动关系，可能无法享受工伤保险待遇和其他相关权益。因此，双方都应重视劳动关系的认定和证据收集工作。