结论：若签离职协议约定三日内结清工资，一般情况下用人单位应按此履行；若未履行，劳动者可通过协商、投诉、仲裁或诉讼等途径维权。以下为详细分析：
协议的法律效力
- 离职协议是劳动者与用人单位就劳动关系解除及相关事宜达成的合意，只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不存在欺诈、胁迫或者乘人之危等情形，该协议就是合法有效的，对双方均具有法律约束力。
- 协议中约定“三日内结清工资”，这是双方对于工资支付时间的明确约定，用人单位应当按照此约定履行支付工资的义务。
用人单位未按时支付工资的应对措施
- 协商解决：劳动者可以先与用人单位进行友好协商，了解用人单位未按时支付工资的原因，并要求其按照协议约定尽快支付工资。在协商过程中，劳动者可以保留好相关的沟通记录，如聊天记录、通话录音等，以备后续维权使用。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查和处理，责令用人单位限期支付工资。劳动者在投诉时，需要提供相关的证据材料，如离职协议、工资条、考勤记录等，以证明用人单位存在未按时支付工资的事实。
- 申请劳动仲裁：劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是解决劳动争议的一种重要方式，其裁决具有法律效力。在申请劳动仲裁时，劳动者需要提交仲裁申请书、相关证据材料等，并按照仲裁委员会的要求参加仲裁活动。如果仲裁裁决支持劳动者的诉求，用人单位应当在规定的期限内履行裁决义务。
- 提起诉讼：如果劳动者对劳动仲裁裁决不服，或者用人单位在规定期限内不履行仲裁裁决义务，劳动者可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，劳动者需要提供充分的证据证明自己的主张，法院将根据事实和法律作出判决。如果法院判决支持劳动者的诉求，用人单位必须履行判决义务，否则劳动者可以申请强制执行。
注意事项
- 保留证据：在整个维权过程中，劳动者要注意保留好相关的证据材料，如离职协议、工资条、考勤记录、沟通记录等。这些证据将有助于证明劳动者与用人单位之间存在劳动关系、用人单位未按时支付工资等事实，为劳动者的维权提供有力支持。
- 注意时效：劳动者在维权时要注意时效问题。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者要在规定的时效内及时申请仲裁或提起诉讼，以免丧失维权的机会。