没有任命书的科室主任，在法律上一般不能直接否认其职务，但具体情况需结合实际证据和公司规定来判断。以下从几个角度为你详细分析：

1. 职务认定的法律基础：

   • 在公司法务领域，职务的认定通常基于公司的正式任命文件、公司章程、员工手册或相关规章制度。这些文件是确认员工职务和职责的直接证据。
   • 如果没有正式的任命书，但公司通过其他方式（如内部邮件、会议记录、口头通知等）明确了某员工的科室主任职务，且该员工在实际工作中也履行了科室主任的职责，那么从法律上讲，该员工仍然可以被视为科室主任。

2. 实际履行职务的影响：

   • 即使没有任命书，如果员工在实际工作中长期、稳定地履行了科室主任的职责，包括管理科室事务、分配工作任务、参与公司决策等，那么这些实际行为也可以作为认定其职务的依据。
   • 在这种情况下，如果员工试图否认其职务，可能会面临法律上的不利后果，因为其行为已经构成了对职务的默认接受。

3. 公司规定与内部流程：

   • 不同公司对于职务任命和确认可能有不同的规定和流程。有些公司可能更注重书面文件，而有些公司则可能更注重实际行为和口头确认。
   • 因此，在没有任命书的情况下，需要查阅公司的相关规定和流程，以确定如何确认员工的职务。如果公司规定中没有明确要求必须有任命书才能确认职务，那么实际履行职务的行为就可能成为确认职务的关键。

4. 法律建议与风险防范：

   • 对于公司而言，为了避免类似的职务争议，建议制定明确的职务任命和确认流程，并确保所有任命都以书面形式进行，以便在需要时提供法律证据。
   • 对于员工而言，如果发现自己没有任命书但实际履行了科室主任的职责，建议与公司沟通确认职务，并要求公司出具正式的任命书或相关证明文件，以保障自己的合法权益。

可能面临的法律后果：

• 如果员工在没有任命书的情况下否认其职务，但公司能够提供其他证据证明该员工实际履行了科室主任的职责，那么员工可能会面临被公司追究责任的风险，包括但不限于违反公司规定、不履行工作职责等。
• 另一方面，如果公司无法提供足够证据证明员工的职务，而员工又坚决否认，那么这可能会引发一场关于职务认定的法律争议，需要通过法律途径来解决。

综上所述，没有任命书的科室主任在法律上不能直接否认其职务，但具体情况需结合实际证据和公司规定来判断。如果你或你的公司面临类似的问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议。