结论前置：能否以未招投标为由抗辩合同款项支付，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
合同效力与招投标的关系
- 必须招投标的项目未招投标：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，对于必须进行招投标的项目，如果未进行招投标而直接签订合同，该合同可能因违反法律强制性规定而被认定为无效。在此情况下，如果合同被确认无效，那么基于该合同产生的支付款项的义务也可能受到影响，但并非绝对免除支付责任。因为合同无效后，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。所以，如果因未招投标导致合同无效，但对方已经实际履行了合同义务（如提供了服务或交付了货物），那么支付款项的义务可能仍然存在，只是可能需要根据双方的过错程度来分担损失。
- 非必须招投标的项目未招投标：对于非必须进行招投标的项目，即使未进行招投标，也不影响合同的效力。因此，不能以未招投标为由抗辩合同款项的支付。
抗辩权的行使条件
- 抗辩事由的合法性：抗辩权是法律赋予当事人的一种权利，但行使抗辩权必须基于合法的事由。未招投标本身并不直接构成抗辩合同款项支付的理由，除非该未招投标行为导致了合同无效或存在其他法定抗辩事由（如合同欺诈、胁迫等）。
- 抗辩权的及时行使：如果当事人打算以未招投标为由抗辩合同款项支付，应当在法定的期限内及时行使抗辩权。逾期行使抗辩权可能导致抗辩权的丧失。
实际履行与抗辩的关系
- 实际履行情况：如果合同已经实际履行，且对方已经按照合同约定提供了服务或交付了货物，那么即使合同存在未招投标等瑕疵，也不能简单地以未招投标为由拒绝支付款项。因为实际履行行为已经表明双方对合同的认可和执行。
- 抗辩与实际履行的冲突：在实际履行过程中，如果一方以未招投标为由抗辩支付款项，而另一方已经实际履行了合同义务，那么法院或仲裁机构在裁决时可能会考虑实际履行情况、双方的过错程度以及合同的目的和性质等因素来综合判断是否支持抗辩请求。
法律建议：
- 在面对是否可以以未招投标为由抗辩合同款项支付的问题时，首先应当审查合同是否属于必须进行招投标的项目。如果是必须招投标的项目而未进行招投标，再进一步审查合同是否因此被确认无效以及实际履行情况等因素。
- 如果合同被确认无效或存在其他法定抗辩事由，且符合抗辩权的行使条件，那么可以考虑行使抗辩权。但在此之前，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和指导。
- 在任何情况下，都应当注重保留相关证据和文件，以便在需要时能够证明自己的主张和权益。
可能法律后果：
- 如果以未招投标为由抗辩合同款项支付不当或缺乏法律依据，可能会面临败诉的风险，并需要承担对方因此产生的损失和费用。
- 如果合同确实存在未招投标等瑕疵，但抗辩请求未得到支持，那么仍然需要按照合同约定履行支付款项的义务。否则，可能会面临违约责任和法律制裁。
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