结论前置：违规操作造成的工伤，用人单位扣费一般是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：

从法律规定角度

根据《工伤保险条例》等相关法律法规，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。用人单位应当按时缴纳工伤保险费，职工个人不缴纳工伤保险费。职工发生工伤时，用人单位应采取措施使工伤职工得到及时救治，并且承担相应的工伤赔偿责任，而不能因为职工违规操作就随意扣费。

例如，小李在工厂工作时，由于自己违规操作机器导致受伤。工厂不能因为小李违规操作就拒绝支付其工伤医疗费用或者扣除其工资。因为工伤保险的目的是保障职工在工作中受到伤害时能够获得及时的救治和经济补偿，违规操作并不影响职工享受工伤保险待遇这一基本权利。

从用人单位管理角度

虽然用人单位不能因为职工违规操作造成工伤就扣费，但这并不意味着职工违规操作不需要承担任何责任。用人单位可以依据内部规章制度对违规操作的职工进行相应的纪律处分，比如警告、记过、降职等。不过，这些纪律处分不能与工伤赔偿混为一谈，也不能以扣费的形式来体现。

比如，某公司规定员工违规操作机器将给予警告处分，并扣除当月部分绩效奖金。但如果该员工因违规操作受伤，公司不能因为要执行这个规定就拒绝支付其工伤期间的工资或者医疗费用。公司可以在员工伤愈复工后，根据规定对其进行警告处分和扣除绩效奖金，但不能将两者与工伤赔偿挂钩。

从特殊情况角度

有一种特殊情况需要注意，如果职工的违规操作行为构成了故意犯罪、醉酒或者吸毒、自残或者自杀等《工伤保险条例》中规定的不得认定为工伤或者视同工伤的情形，那么职工将无法享受工伤保险待遇，用人单位也无需承担工伤赔偿责任。但这种情况与一般的违规操作造成工伤是有本质区别的，不能一概而论。

例如，小张在工作期间故意违反操作规程，并且是在醉酒状态下操作机器导致受伤。这种情况下，小张的行为符合不得认定为工伤的情形，用人单位不需要为其承担工伤赔偿责任，但这并不是因为简单的违规操作就扣费，而是基于法律规定的特殊情形。

法律建议：如果你遇到了用人单位因违规操作造成工伤而扣费的情况，可以先与用人单位进行协商，要求其停止扣费行为并支付相应的工伤赔偿。如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。有问题直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律帮助。