结论：通过扣款胁迫劳动者上班，确实可能构成违反《劳动合同法》第88条的情形，但具体是否构成违法需结合实际情况判断。
分析如下：
- 《劳动合同法》第88条的内容：
该条款主要规定了用人单位有下列情形之一的，依法给予行政处罚；构成犯罪的，依法追究刑事责任；给劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任：
- 以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动的；
- 违章指挥或者强令冒险作业危及劳动者人身安全的；
- 侮辱、体罚、殴打、非法搜查或者拘禁劳动者的；
- 劳动条件恶劣、环境污染严重，给劳动者身心健康造成严重损害的。
其中，“以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动的”与您提到的“通过扣款胁迫劳动者上班”有一定的关联性。虽然直接的法律条文并未明确提及“扣款胁迫”，但“威胁”这一表述具有广泛的涵盖性，可以包括通过经济手段（如扣款）对劳动者进行胁迫。
扣款胁迫的具体分析：
- 如果用人单位通过扣款的方式，明确或隐含地表示如果劳动者不按时上班或完成工作任务，就会扣除其工资或奖金，且这种扣款行为没有合法的依据（如劳动合同中的明确约定或法律法规的允许），那么这种行为很可能被视为一种“威胁”，从而构成违反《劳动合同法》第88条的情形。
- 另一方面，如果扣款行为是基于合法的劳动合同约定或公司规章制度，且这些约定或制度本身不违反法律法规的强制性规定，同时扣款的目的也是为了维护公司的正常运营秩序或保障劳动者的劳动纪律，那么这种扣款行为可能不构成违法。但即便如此，用人单位在实施扣款时也应遵循合法、合理、透明的原则，确保劳动者的合法权益不受侵害。
法律后果与建议：
- 如果用人单位的扣款胁迫行为被认定为违法，那么用人单位可能面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任等法律后果。
- 对于劳动者而言，如果遭遇此类情况，建议首先与用人单位进行沟通协商，尝试通过和平方式解决问题。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
额外提醒：
- 在处理此类纠纷时，劳动者应尽可能收集并保留相关证据，如劳动合同、工资条、扣款通知、沟通记录等，以便在后续的法律程序中证明自己的主张。
- 每个案件的具体情况都有所不同，因此在实际操作中还需根据具体情况进行具体分析。如果您或您身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。