结论：工伤治疗期间，公司扣绩效工资的行为通常是不合法的。
法律背景与解释：
工伤期间的工资待遇：
- 根据《工伤保险条例》第三十三条的规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常包括基本工资、绩效工资、奖金等所有组成部分。
绩效工资的性质：
- 绩效工资是员工工资的一部分，它根据员工的工作表现、业绩等因素来确定。在工伤治疗期间，员工虽然暂时无法工作，但这并非由于其个人原因或过错导致，而是由于工作原因受伤。因此，公司不应因员工工伤治疗而扣除其绩效工资。
公司的违法行为及后果：
- 如果公司扣除工伤员工的绩效工资，这违反了《工伤保险条例》的规定，员工有权要求公司补发被扣除的工资，并可能因此向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司承担相应的法律责任。
法律建议：
与公司沟通：
- 首先，你可以尝试与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确表达你的诉求，即要求公司按照法律规定支付你工伤治疗期间的全部工资，包括绩效工资。
收集证据：
- 在沟通过程中，注意收集相关证据，如工资条、考勤记录、工伤认定书等，以证明公司确实扣除了你的绩效工资，以及你因工作原因受伤的事实。
寻求法律援助：
- 如果公司拒绝支付或沟通无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，要求公司补发被扣除的工资，并可能要求公司支付相应的经济补偿。在此过程中，如果你需要专业的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。
可能的法律后果：
- 如果公司被认定违反了《工伤保险条例》的规定，除了需要补发被扣除的工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，公司的行为也可能影响其声誉和员工关系，对公司的长期发展产生不利影响。
总之，工伤治疗期间，公司扣绩效工资的行为是不合法的。你有权要求公司按照法律规定支付你全部的工资待遇。如果公司拒绝支付或沟通无果，你可以通过法律途径维护自己的合法权益。