针对您提出的“员工离职申请超76天怎么处理”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
首先，根据《劳动法》第三十一条以及劳动部办公厅关于劳动者解除劳动合同有关问题的复函（劳办发〔1995〕324号）中的明确规定，劳动者解除劳动合同，应当提前三十日以书面形式通知用人单位。这是解除劳动合同的程序，也是条件。一旦劳动者提前三十日以书面形式通知了用人单位，那么超过这三十日之后，劳动者向用人单位提出办理解除劳动合同的手续，用人单位应当予以办理。
针对您的情况：
离职申请已超76天：
- 既然员工已经提前（且远超过）三十日以书面形式通知了用人单位其离职意向，那么从法律角度讲，员工已经满足了离职的程序和条件。
- 超过三十日后，员工有权要求用人单位办理离职手续，用人单位不得拒绝。
用人单位应如何处理：
- 用人单位应当积极与员工沟通，确认其离职意愿，并尽快安排办理离职手续，包括但不限于工作交接、薪资结算、社保转移等。
- 如果员工在离职过程中存在违反劳动合同或公司规章制度的行为（如未按规定交接工作、泄露公司机密等），用人单位可以依据相关法律法规和劳动合同的约定，要求员工承担相应的赔偿责任。但这一处理与员工提前通知离职的事实是分开的，不影响离职手续的办理。
特殊情况处理：
- 如果员工在离职申请中提出了某些特殊要求或条件，用人单位应根据实际情况和法律法规进行协商处理。
- 如果员工离职后未按规定交接工作或造成公司损失，公司可以依法追究其责任，但这需要通过法律途径解决，不影响离职手续的初步办理。
参考案例：
- 如您提供的第二个参考信息所示，即使员工离职后未配合交接工作微信号等，公司也可以通过法律途径追究其侵权责任并要求赔偿。但这并不改变员工已满足离职条件的事实。
总结建议：
- 用人单位应尽快与员工沟通，确认离职意愿，并安排办理离职手续。
- 如果员工在离职过程中存在违规行为，用人单位应依法追究其责任，但这应作为另一独立事项处理。
- 双方应保持沟通，确保离职过程平稳、有序进行，避免不必要的法律纠纷。
希望以上解答能对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的法律建议，请随时咨询。