关于全民所有制企业的合同工在两个单位工作退休时工龄是否连续计算的问题，结论是：工龄是否连续计算，需视具体情况而定，主要取决于两个单位的工作经历是否符合工龄连续计算的条件。以下从不同角度进行详细分析：
一、工龄连续计算的一般原则
工龄连续计算，通常指的是劳动者在不同单位或同一单位的不同岗位工作期间，其工作时间能够连续计算，不受单位变更或岗位变动的影响。在全民所有制企业中，合同工的工龄计算也遵循这一原则，但具体是否连续计算，还需根据相关规定和实际情况来判断。
二、影响工龄连续计算的因素
工作调动性质：
- 正式调动：如果劳动者从一个全民所有制企业正式调动到另一个全民所有制企业，且调动过程中劳动关系保持连续，没有中断，那么其工龄通常可以连续计算。
- 非正式调动或自行离职：如果劳动者是自行离职或通过非正式方式（如临时借调、兼职等）在两个单位工作，且劳动关系在调动过程中发生了中断，那么其工龄可能无法连续计算。
社保缴纳情况：
- 社保缴纳是工龄计算的重要依据之一。如果劳动者在两个单位工作期间，社保缴纳记录连续且未中断，那么其工龄更有可能被认定为连续计算。
- 如果社保缴纳记录存在中断或重复缴纳的情况，可能会影响工龄的连续计算。
档案材料完整性：
- 劳动者的档案材料，如劳动合同、工作调动证明、社保缴纳记录等，是工龄计算的重要依据。如果档案材料完整且能够证明劳动者在两个单位的工作经历是连续的，那么其工龄更有可能被认定为连续计算。
- 如果档案材料缺失或存在矛盾，可能会影响工龄的连续计算。
三、具体案例分析
- 案例一：劳动者A从全民所有制企业甲正式调动到全民所有制企业乙，调动过程中劳动关系保持连续，且社保缴纳记录未中断。在此情况下，劳动者A的工龄可以连续计算。
- 案例二：劳动者B在全民所有制企业甲工作期间，自行离职到全民所有制企业乙工作，且未办理正式调动手续。在此情况下，劳动者B在两个单位的工作经历可能无法被认定为连续计算工龄。
四、法律建议
- 保留好相关证据：劳动者应妥善保管好自己的劳动合同、工作调动证明、社保缴纳记录等档案材料，以便在需要时证明自己的工龄。
- 咨询当地社保部门或劳动部门：由于工龄计算可能受到地方政策的影响，劳动者在遇到具体问题时，可以咨询当地社保部门或劳动部门，了解具体的工龄计算政策和流程。
- 如有争议，及时寻求法律帮助：如果劳动者与用人单位在工龄计算问题上存在争议，可以及时寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，全民所有制企业的合同工在两个单位工作退休时工龄是否连续计算，需根据具体情况来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。