针对员工劳动仲裁申请违法辞退赔偿金和未休年假工资的情况，公司可以从以下几个方面进行答辩：
关于违法辞退赔偿金的答辩：
- 辞退合法性：公司应首先审查辞退员工的决定是否合法。如果辞退是基于员工严重违反公司规章制度、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害等合法理由，公司应提供相关证据，如规章制度、员工违规记录、损失证明等，以证明辞退的合法性。
- 程序合规性：公司还需确保辞退程序符合法律法规和公司规章制度的要求，如提前通知、听取员工意见、工会或职工代表大会的参与等。如果程序存在瑕疵，公司应说明瑕疵不影响辞退的合法性，或者提供补救措施的证据。
- 赔偿金计算：如果辞退被认定为违法，公司应核对员工主张的赔偿金计算是否正确。根据《劳动合同法》的相关规定，违法辞退的赔偿金应为经济补偿金的两倍，经济补偿金按员工在公司工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准计算。公司应提供员工的工资记录、工作年限证明等，以准确计算赔偿金数额。
关于未休年假工资的答辩：
- 年假制度：公司应首先说明公司的年假制度，包括年假的天数、申请流程、未休年假的处理方式等。如果公司有明确的年假制度，并且员工未按照制度申请年假，公司可以主张员工放弃年假权利。
- 未休年假原因：如果员工确实未休年假，公司应说明未休年假的原因。如果是因为员工个人原因（如主动放弃、未提出申请等）导致未休年假，公司可以主张不支付未休年假工资。如果是因为公司原因（如工作安排、经营需要等）导致员工未休年假，公司应按照法律法规和公司制度支付未休年假工资。
- 工资计算：如果公司需要支付未休年假工资，应核对员工主张的工资计算是否正确。未休年假工资应按照员工日工资收入的300%支付，其中包含公司已支付员工正常工作期间的工资收入。公司应提供员工的工资记录、考勤记录等，以准确计算未休年假工资数额。
在答辩过程中，公司还需注意以下几点：
- 证据充分性：公司应确保提供的证据充分、真实、有效，能够支持公司的答辩主张。
- 答辩时效性：公司应在规定的答辩期限内提交答辩材料，避免逾期提交导致的不利后果。
- 法律合规性：公司的答辩主张应符合法律法规的要求，避免提出违法或无效的答辩理由。
如果公司在答辩过程中遇到困难或不确定如何答辩，建议及时咨询专业律师，以确保答辩的合法性和有效性。作为专注于交通事故赔偿、工伤赔偿领域的律师，我也可以为你提供相关的法律咨询和帮助，如果你有具体的问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。