针对您提出的问题“员工因为住院打电话通知单位不能去办理离职手续是否合法”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们要明确的是，员工在住院期间，由于身体原因无法亲自前往单位办理离职手续，这是客观存在的困难。在这种情况下，员工通过电话或其他方式及时通知单位，表明其因病无法继续工作并希望办理离职的意愿，这是合理且必要的。

接下来，我们参考相关法律法规和案例来进一步分析：

1. 法律法规依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，劳动者在患病期间享有医疗假，企业在此期间不得随意解除劳动合同。这意味着，员工在住院期间，其劳动关系是受到法律保护的，单位不能仅凭员工未亲自办理离职手续就单方面解除劳动合同。

2. 案例参考：

   • 类似案例中，如保安孙某因突发重感冒住院，仅通过电话向部门主管说明了情况，未按照公司规定的流程提交书面请假申请。但法院在审理时，考虑了孙某因病未能及时履行请假手续的具体情况，并依据劳动法规定，判决公司撤销对孙某的自动离职决定，恢复其劳动关系。这表明，法院在处理此类案件时，会充分考虑员工的实际情况和特殊需求，避免机械地套用公司规章制度。

3. 单位应如何处理：

   • 单位在处理员工请假或离职事宜时，应充分考虑员工的实际情况和特殊需求。对于因病无法亲自办理离职手续的员工，单位可以要求员工提供医疗证明或其他相关证据，以证明其确实因病无法继续工作。同时，单位也可以与员工协商，通过邮寄、电子邮件等方式办理离职手续，或者安排其他人员代为办理。

4. 员工应如何做：

   • 员工在住院期间，应尽可能通过电话、电子邮件或其他方式及时通知单位，表明其因病无法继续工作并希望办理离职的意愿。同时，员工也应尽量提供医疗证明或其他相关证据，以支持其离职申请。

综上所述，员工因为住院打电话通知单位不能去办理离职手续，在法律上是合理的。单位在处理此类情况时，应充分考虑员工的实际情况和特殊需求，避免机械地套用公司规章制度。如果单位因此单方面解除劳动合同，员工可以通过法律途径维护自己的合法权益。