结论前置：公司依法发出的医疗期满解除劳动合同通知书，即使员工不同意或不去办理离职手续，劳动合同在法律上仍然可以解除。但员工应了解自身权益，并根据具体情况采取相应措施。
一、公司解除劳动合同的合法性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条，当劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作时，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。
合法解除的条件：
- 医疗期已满：公司需准确核实员工的工作年限及对应的法定医疗期，确保医疗期确实已结束。
- 不能从事原工作：医疗期满后，公司应首先安排员工回到原岗位尝试工作。如员工因健康原因无法胜任，需收集相关证据（如病假条、诊断证明等）。
- 另行安排工作仍不能胜任：公司需为员工另行安排合适的工作，考虑其身体状况、技能和经验。若员工仍无法胜任，则具备解除劳动合同的条件。
- 遵循法定程序：解除劳动合同前，公司需提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资，并按法律规定支付经济补偿。
二、员工不去办理离职手续的法律后果
劳动合同解除的效力：
- 即使员工不去办理离职手续，只要公司解除劳动合同的行为合法，劳动合同在法律上仍然可以解除。员工不去办理离职手续，并不影响劳动合同解除的效力。
员工可能面临的法律责任：
- 如果员工拒绝办理离职手续，公司有权根据内部规章制度或相关法律法规，采取相应的措施，如暂停支付工资、停止缴纳社会保险等。
- 在极端情况下，如果员工的行为给公司造成了损失，公司还有权要求员工承担赔偿责任。
三、员工的权益保护与应对措施
了解自身权益：
- 员工应了解自己在医疗期满后的权益，包括是否能够从事原工作或另行安排的工作，以及公司解除劳动合同的合法性和程序等。
与公司协商：
- 如果员工对公司的解除劳动合同通知书有异议，可以与公司进行协商，寻求合理的解决方案。例如，员工可以提出调整工作岗位、延长医疗期等建议。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果员工认为公司的解除劳动合同行为违法，或者公司未按照法律规定支付经济补偿等，员工可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
四、特殊情况下的处理
员工存在特殊保护情形：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条，如果员工存在从事接触职业病危害作业未进行离岗前职业健康检查、在本单位患职业病或因工负伤并被确认丧失或部分丧失劳动能力、女职工在孕期产期哺乳期等特殊保护情形，即使医疗期满后员工不能从事原工作或另行安排的工作，公司也不得解除劳动合同。
公司解除行为违法：
- 如果公司解除劳动合同的行为违法，如未提前三十日以书面形式通知员工、未支付经济补偿等，员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。
温馨提示：作为员工，在收到公司发出的医疗期满解除劳动合同通知书后，应了解自己的权益和义务，并根据具体情况采取相应的措施。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。