结论：疾控部门在特定情况下可以告知单位职工查出传染病的情况，但需严格遵循相关法律法规的规定，确保个人隐私得到保护。
分析说明：
法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国传染病防治法》的相关规定，疾控机构、医疗机构和采供血机构及其执行职务的人员，在发现本法规定的传染病疫情或者发现其他传染病暴发、流行以及突发原因不明的传染病时，应当遵循疫情报告属地管理原则，按照国务院规定的或者国务院卫生行政部门规定的内容、程序、方式和时限报告。
- 同时，该法也强调了对传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人的隐私保护，任何单位和个人不得泄露其个人信息和病情。
疾控部门告知单位的条件：
- 在一般情况下，疾控部门不会直接告知单位职工查出传染病的情况，以保护个人隐私。
- 但是，在特定情况下，如职工患有的传染病属于法定报告的传染病，且该传染病的传播可能对单位其他职工或公众健康构成威胁时，疾控部门可能会根据疫情防控的需要，在严格保护个人隐私的前提下，向单位提供必要的防控建议或信息。
- 这种情况下，疾控部门通常会与单位进行沟通，说明告知的必要性和目的，并确保单位采取适当的防控措施，同时要求单位对职工的个人信息保密。
单位的责任与义务：
- 如果疾控部门告知了单位职工查出传染病的情况，单位有责任和义务采取必要的防控措施，如安排职工进行隔离治疗、对工作环境进行消毒等，以防止传染病的传播。
- 同时，单位也有义务保护职工的个人隐私，不得泄露其病情和相关信息，避免对职工造成不必要的困扰和歧视。
特殊场景：
- 在某些特殊情况下，如职工患有的传染病属于高致病性、高传染性的疾病，且单位的工作环境或工作性质可能加剧疾病的传播时，疾控部门可能会更倾向于向单位提供必要的信息，以便单位能够及时采取防控措施。
- 但是，即使在这种情况下，疾控部门也会严格遵循法律法规的规定，确保个人隐私得到最大程度的保护。
建议与行动：
- 如果您作为单位负责人或职工，对疾控部门告知单位职工查出传染病的情况有疑问或担忧，建议首先与疾控部门进行沟通，了解告知的具体原因和目的。
- 同时，您也可以咨询专业的法律人士，如我这样的劳动工伤律师，以了解相关法律法规的规定和您的权利义务。
- 在处理此类情况时，请务必保持冷静和理性，遵循法律法规的规定，采取适当的防控措施，保护职工和公众的健康安全。
如有任何进一步的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。