结论前置：综合工时制下，单位不可以随意更改考勤结算时间，需遵循法定程序与条件，否则可能构成违法。以下从多个角度展开说明：

1. 综合工时制的本质与考勤结算时间的法律意义
   综合工时制是针对因工作性质特殊需连续作业或受季节影响的岗位，经劳动行政部门审批后，以周、月、季、年为周期综合计算工作时间的制度。其核心在于“综合计算周期”内的总工时不超过法定标准（如月166.64小时），而非允许单位单方面调整考勤结算周期。考勤结算时间直接关联工资计算、加班费认定及劳动者权益，属于劳动合同的必备条款之一，受《劳动合同法》严格保护。

2. 单位更改考勤结算时间的合法性条件
   根据《劳动合同法》第35条，变更劳动合同（包括考勤结算时间）需满足两个条件：

   • 协商一致：单位必须与劳动者或工会协商，并达成书面协议；
     
   • 不损害劳动者权益：更改后的结算周期不得导致劳动者实际工作时间被低估、加班费被少算或工资支付延迟。例如，若原以月为周期结算，单位擅自改为季度结算，可能因工资支付周期过长违反《工资支付暂行规定》第7条（工资至少每月支付一次），构成拖欠工资。

3. 未经合法程序更改的法律后果

   • 行政责任：劳动行政部门可责令单位限期改正，逾期不改的处以罚款（《劳动保障监察条例》第30条）；
     
   • 民事责任：劳动者可要求单位按原约定支付工资及加班费，并可能主张经济补偿金（《劳动合同法》第38、46条）；
     
   • 举证责任倒置：若单位主张已协商变更，需承担举证责任，否则承担不利后果（《劳动争议调解仲裁法》第6条）。

4. 实务建议

   • 对单位：若需调整考勤结算周期，应提前与劳动者或工会协商，签订补充协议，并确保工资支付周期符合法律规定；
     
   • 对劳动者：若单位未经协商擅自更改，可先书面提出异议并保留证据（如邮件、录音），若单位拒不改正，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：综合工时制下，考勤结算时间的调整需严格遵循法定程序，单位无权单方面随意更改。若您遇到此类问题，可进一步提供具体细节（如原结算周期、单位更改方式等），我将为您分析具体风险及应对方案。