底薪只有1000元是否合法，需分情况讨论：

1. 若该底薪低于当地最低工资标准，则不合法。

   • 法律背景：根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条，国家实行最低工资保障制度。用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。最低工资标准一般由省、自治区、直辖市人民政府规定，并报国务院备案。
   • 具体分析：如果1000元的底薪低于您所在地区的最低工资标准，那么用人单位的这一做法就是违法的。您有权要求用人单位按照最低工资标准支付工资，并可以向当地劳动保障监察机构投诉或申请劳动争议仲裁。
   • 建议行动：首先，您需要了解您所在地区的最低工资标准是多少。这可以通过查询当地政府或劳动保障部门的官方网站、咨询当地劳动保障监察机构或拨打劳动保障热线电话来获取。如果确认1000元低于最低工资标准，您可以与用人单位协商，要求其按照最低工资标准支付工资；如果协商无果，您可以向当地劳动保障监察机构投诉或申请劳动争议仲裁。

2. 若该底薪不低于当地最低工资标准，但需结合其他收入判断整体收入是否合法。

   • 法律背景：虽然底薪不低于最低工资标准是合法的，但劳动者的整体收入（包括底薪、奖金、津贴、补贴等）也应符合相关法律法规的规定。例如，如果用人单位通过降低底薪但大幅提高提成或奖金的方式，导致劳动者实际收入不稳定或低于合理水平，这也可能构成违法行为。
   • 具体分析：在这种情况下，您需要综合考虑您的整体收入情况。如果底薪虽然不低于最低工资标准，但您的其他收入（如提成、奖金等）不稳定或很少，导致您的实际收入远低于同行业或同岗位的平均水平，那么您可能需要与用人单位协商调整薪酬结构或寻求法律援助。
   • 建议行动：您可以先了解同行业或同岗位的平均工资水平，然后与您的实际收入进行对比。如果发现明显偏低，您可以与用人单位协商调整薪酬结构或要求增加底薪；如果协商无果，您可以考虑向当地劳动保障监察机构投诉或申请劳动争议仲裁，以维护您的合法权益。

额外提醒：

• 在处理此类问题时，建议您保留好相关证据，如工资条、劳动合同、工作记录等，以便在需要时提供证明。
• 如果您对当地最低工资标准或相关法律法规不了解，可以向当地劳动保障部门或专业律师咨询，以获取更准确的法律信息和建议。

总结：底薪只有1000元是否合法，取决于它是否低于当地最低工资标准以及您的整体收入情况。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。